Wieske, Martin: Beiträge zur Struktur und Funktion des kleinen Säuger-Streßproteins HSP25 unter besonderer Berücksichtigung der Wechselwirkung mit Actin

91

Abkürzungen

AK

Antikörper

AP

Alkalische Phosphatase

ATP

Adenosin-5´-triphosphat

BSA

Rinder-Serumalbumine (bovine serum albumine)

beta-ME

beta-Mercaptoethanol

cDNA

komplementäre DNA (complementary DNA)

DEAE

Dimethylaminoethyl

DTT

Dithiothreitol

DTE

1,4-Dithioerythrit

dpi

Pixel pro inch (dots per inch)

EAT

Ehrlich-Ascites-Tumor

E. coli

Escherichia coli

EDTA

Ethylendiamin-tetraacetat

ERK

durch extrazelluläre Signale regulierte Proteinkinase

F-Actin

fibrilläres Actin

FPLC

Niederdruck-Flüssigkeitschromatographie (fast pressure liquid chromatography)

G-Actin

globuläres Actin

HEPES

4-(2-Hydroxyethyl)-piperazin-1-ethansulfonsäure

HPLC

Hochdruck-Flüssigkeitschromatographie (high pressure liquid chromatography)

HRP

Meerrettich-Peroxidase (horseradish peroxidase)

HSE

Hitzeschockelement

HSP

Hitzeschockprotein

kHSPs

kleine Hitzeschockproteine

kDa

kilo-Dalton

MAPK

Mitogen-aktivierte Proteinkinase

MAPKAPK

Mitogen-aktivierte- Proteinkinase aktivierte Proteinkinase

MEK

MAPK/ERK-Kinase

MKK

MAPK-Kinase

Mr

Molekulargewicht

mRNA

Boten-Ribonucleinsäure (messenger ribonucleic acid)

MSA

Multivariate Statistische Analyse

PBS

Tris-gepufferte Kochsalzlösung (phosphate-buffered saline)

PKC

Proteinkinase C

PDGF

Blutplättchen-Wachstumsfaktor (platelet-derived growth factor)

PMSF

Phenylmethansulfonylfluorid

PP2A/B

Proteinphosphatase 2A/B

PVDF

Polyvinyldifluorid

s

Sekunde

SD

Sprague-Dawley-Ratten

SDS

Natriumdodecylsulfat (sodium dodecylsulfate)

SH3

src-Homologie 3

TBS

Tris-gepufferte Kochsalzlösung (Tris-buffered saline)

TEMED

N,N,N',N'-Tetramethylethylendiamin

TNFalpha

Tumornekrosefaktor alpha

Tris

Tris-(Hydroxylmethyl)-aminomethan

WKY

Wistar-Kyoto-Ratten


92

Tab. 15: Abkürzungen der Aminosäuren

A

Ala

Alanin

M

Met

Methionin

C

Cys

Cystein

N

Asn

Asparagin

D

Asp

Asparaginsäure

P

Pro

Prolin

E

Glu

Glutaminsäure

Q

Gln

Glutamin

F

Phe

Phenylalanin

R

Arg

Arginin

G

Gly

Glycin

S

Ser

Serin

H

His

Histidin

T

Thr

Threonin

I

Ile

Isoleucin

V

Val

Valin

K

Lys

Lysin

W

Trp

Tryptophan

L

Leu

Leucin

Y

Tyr

Tyrosin

Tab. 16: Sequenzen der Zellulose-gebundenen HSP25-Peptid-Bibliothek (HSP25 der Maus)

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

1

MTERRVPFSLLRS

26

GWPGYVRPLPAAT

51

VSLDVNHFAPEEL

76

GVDPTLVSSSLSP

2

ERRVPFSLLRSPS

27

PGYVRPLPAATAE

52

LDVNHFAPEELTV

77

DPTLVSSSLSPEG

3

RVPFSLLRSPSWE

28

YVRPLPAATAEGP

53

VNHFAPEELTVKT

78

TLVSSSLSPEGTL

4

PFSLLRSPSWEPF

29

RPLPAATAEGPAA

54

HFAPEELTVKTKE

79

VSSSLSPEGTLTV

5

SLLRSPSWEPFRD

30

LPAATAEGPAAVT

55

APEELTVKTKEGV

80

SSLSPEGTLTVEA

6

LRSPSWEPFRDWY

31

AATAEGPAAVTLA

56

EELTVKTKEGVVE

81

LSPEGTLTVEAPL

7

SPSWEPFRDWYPA

32

TAEGPAAVTLAAP

57

LTVKTKEGVVEIT

82

PEGTLTVEAPLPK

8

SWEPFRDWYPAHS

33

EGPAAVTLAAPAF

58

VKTKEGVVEITGK

83

GTLTVEAPLPKAV

9

EPFRDWYPAHSRL

34

PAAVTLAAPAFSR

59

TKEGVVEITGKHE

84

LTVEAPLPKAVTQ

10

FRDWYPAHSRLFD

35

AVTLAAPAFSRAL

60

EGVVEITGKHEER

85

VEAPLPKAVTQSA

11

DWYPAHSRLFDQA

36

TLAAPAFSRALNR

61

VVEITGKHEERQD

86

APLPKAVTQSAEI

12

YPAHSRLFDQAFG

37

AAPAFSRALNRQL

62

EITGKHEERQDEH

87

LPKAVTQSAEITI

13

AHSRLFDQAFGVP

38

PAFSRALNRQLSS

63

TGKHEERQDEHGY

88

KAVTQSAEITIPV

14

SRLFDQAFGVPRL

39

FSRALNRQLSSGV

64

KHEERQDEHGYIS

89

VTQSAEITIPVTF

15

LFDQAFGVPRLPD

40

RALNRQLSSGVSE

65

EERQDEHGYISRC

90

QSAEITIPVTFEA

16

DQAFGVPRLPDEW

41

LNRQLSSGVSEIR

66

RQDEHGYISRCFT

91

AEITIPVTFEARA

17

AFGVPRLPDEWSQ

42

RQLSSGVSEIRQT

67

DEHGYISRCFTRK

92

ITIPVTFEARAQI

18

GVPRLPDEWSQWF

43

LSSGVSEIRQTAD

68

HGYISRCFTRKYT

93

IPVTFEARAQIGG

19

PRLPDEWSQWFSA

44

SGVSEIRQTADRW

69

YISRCFTRKYTLP

94

VTFEARAQIGGPE

20

LPDEWSQWFSAAG

45

VSEIRQTADRWRV

70

SRCFTRKYTLPPG

95

FEARAQIGGPEAG

21

DEWSQWFSAAGWP

46

EIRQTADRWRVSL

71

CFTRKYTLPPGVD

96

ARAQIGGPEAGKS

22

WSQWFSAAGWPGY

47

RQTADRWRVSLDV

72

TRKYTLPPGVDPT

97

AQIGGPEAGKSEQ

23

QWFSAAGWPGYVR

48

TADRWRVSLDVNH

73

KYTLPPGVDPTLV

98

IGGPEAGKSEQSG

24

FSAAGWPGYVRPL

49

DRWRVSLDVNHFA

74

TLPPGVDPTLVSS

99

GPEAGKSEQSGAK

25

AAGWPGYVRPLPA

50

WRVSLDVNHFAPE

75

PPGVDPTLVSSSL


93

Tab. 17: Sequenzen der Zellulose-gebundenen Actin-Peptid-Bibliothek (humanes alpha-Skelett-muskel-Actin)

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

Nr.

Sequenz

1

DEDETTALVCDNG

47

ELRVAPEEHPTLL

93

LTDYLMKILTERG

139

TTYNSIMKCDIDI

2

DETTALVCDNGSG

48

RVAPEEHPTLLTE

94

DYLMKILTERGYS

140

YNSIMKCDIDIRK

3

TTALVCDNGSGLV

49

APEEHPTLLTEAP

95

LMKILTERGYSFV

141

SIMKCDIDIRKDL

4

ALVCDNGSGLVKA

50

EEHPTLLTEAPLN

96

KILTERGYSFVTT

142

MKCDIDIRKDLYA

5

VCDNGSGLVKAGF

51

HPTLLTEAPLNPK

97

LTERGYSFVTTAE

143

CDIDIRKDLYANN

6

DNGSGLVKAGFAG

52

TLLTEAPLNPKAN

98

ERGYSFVTTAERE

144

IDIRKDLYANNVM

7

GSGLVKAGFAGDD

53

LTEAPLNPKANRE

99

GYSFVTTAEREIV

145

IRKDLYANNVMSG

8

GLVKAGFAGDDAP

54

EAPLNPKANREKM

100

SFVTTAEREIVRD

146

KDLYANNVMSGGT

9

VKAGFAGDDAPRA

55

PLNPKANREKMTQ

101

VTTAEREIVRDIK

147

LYANNVMSGGTTM

10

AGFAGDDAPRAVF

56

NPKANREKMTQIM

102

TAEREIVRDIKEK

148

ANNVMSGGTTMYP

11

FAGDDAPRAVFPS

57

KANREKMTQIMFE

103

EREIVRDIKEKLC

149

NVMSGGTTMYPGI

12

GDDAPRAVFPSIV

58

NREKMTQIMFETF

104

EIVRDIKEKLCYV

150

MSGGTTMYPGIAD

13

DAPRAVFPSIVGR

59

EKMTQIMFETFNV

105

VRDIKEKLCYVAL

151

GGTTMYPGIADRM

14

PRAVFPSIVGRPR

60

MTQIMFETFNVPA

106

DIKEKLCYVALDF

152

TTMYPGIADRMQK

15

AVFPSIVGRPRHQ

61

QIMFETFNVPAMY

107

KEKLCYVALDFEN

153

MYPGIADRMQKEI

16

FPSIVGRPRHQGV

62

MFETFNVPAMYVA

108

KLCYVALDFENEM

154

PGIADRMQKEITA

17

SIVGRPRHQGVMV

63

ETFNVPAMYVAIQ

109

CYVALDFENEMAT

155

IADRMQKEITALA

18

VGRPRHQGVMVGM

64

FNVPAMYVAIQAV

110

VALDFENEMATAA

156

DRMQKEITALAPS

19

RPRHQGVMVGMGQ

65

VPAMYVAIQAVLS

111

LDFENEMATAASS

157

MQKEITALAPSTM

20

RHQGVMVGMGQKD

66

AMYVAIQAVLSLY

112

FENEMATAASSSS

158

KEITALAPSTMKI

21

QGVMVGMGQKDSY

67

YVAIQAVLSLYAS

113

NEMATAASSSSLE

159

ITALAPSTMKIKI

22

VMVGMGQKDSYVG

68

AIQAVLSLYASGR

114

MATAASSSSLEKS

160

ALAPSTMKIKIIA

23

VGMGQKDSYVGDE

69

QAVLSLYASGRTT

115

TAASSSSLEKSYE

161

APSTMKIKIIAPP

24

MGQKDSYVGDEAQ

70

VLSLYASGRTTGI

116

ASSSSLEKSYELP

162

STMKIKIIAPPER

25

QKDSYVGDEAQSK

71

SLYASGRTTGIVL

117

SSSLEKSYELPDG

163

MKIKIIAPPERKY

26

DSYVGDEAQSKRG

72

YASGRTTGIVLDS

118

SLEKSYELPDGQV

164

IKIIAPPERKYSV

27

YVGDEAQSKRGIL

73

SGRTTGIVLDSGD

119

EKSYELPDGQVIT

165

IIAPPERKYSVWI

28

GDEAQSKRGILTL

74

RTTGIVLDSGDGV

120

SYELPDGQVITIG

166

APPERKYSVWIGG

29

EAQSKRGILTLKY

75

TGIVLDSGDGVTH

121

ELPDGQVITIGNE

157

PERKYSVWIGGSI

30

QSKRGILTLKYPI

76

IVLDSGDGVTHNV

122

PDGQVITIGNERF

168

RKYSVWIGGSILA

31

KRGILTLKYPIEH

77

LDSGDGVTHNVPI

123

GQVITIGNERFRC

169

YSVWIGGSILASL

32

GILTLKYPIEHGI

78

SGDGVTHNVPIYE

124

VITIGNERFRCPE

170

VWIGGSILASLST

33

LTLKYPIEHGIIT

79

DGVTHNVPIYEGY

125

TIGNERFRCPETL

171

IGGSILASLSTFQ

34

LKYPIEHGIITNW

80

VTHNVPIYEGYAL

126

GNERFRCPETLFQ

172

GSILASLSTFQQM

35

YPIEHGIITNWDD

81

HNVPIYEGYALPH

127

ERFRCPETLFQPS

173

ILASLSTFQQMWI

36

IEHGIITNWDDME

82

VPIYEGYALPHAI

128

FRCPETLFQPSFI

174

ASLSTFQQMWITK

37

HGIITNWDDMEKI

83

IYEGYALPHAIMR

129

CPETLFQPSFIGM

175

LSTFQQMWITKQE

38

IITNWDDMEKIWH

84

EGYALPHAIMRLD

130

ETLFQPSFIGMES

176

TFQQMWITKQEYD

39

TNWDDMEKIWHHT

85

YALPHAIMRLDLA

131

LFQPSFIGMESAG

177

QQMWITKQEYDEA

40

WDDMEKIWHHTFY

86

LPHAIMRLDLAGR

132

QPSFIGMESAGIH

178

MWITKQEYDEAGP

41

DMEKIWHHTFYNE

87

HAIMRLDLAGRDL

133

SFIGMESAGIHET

179

ITKQEYDEAGPSI

42

EKIWHHTFYNELR

88

IMRLDLAGRDLTD

134

IGMESAGIHETTY

180

KQEYDEAGPSIVH

43

IWHHTFYNELRVA

89

RLDLAGRDLTDYL

135

MESAGIHETTYNS

181

EYDEAGPSIVHRK

44

HHTFYNELRVAPE

90

DLAGRDLTDYLMK

136

SAGIHETTYNSIM

182

DEAGPSIVHRKCF

45

TFYNELRVAPEEH

91

AGRDLTDYLMKIL

137

GIHETTYNSIMKC

 

 

46

YNELRVAPEEHPT

92

RDLTDYLMKILTE

138

HETTYNSIMKCDI

 

 


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