Die Tabellen mit der Auswertung der Screeningarrays von den vier verwendeten SH3–Domänen und der Regenerierungen zeigen aufgrund der großen Datenmenge von jeweils 2953 Messwerten nur die ersten 20 Werte. Alle Werte in den Tabellen sind geordnet nach den Mean-Werten. Die Erklärung für den Tabellenkopf lautet Peptid–Positionsnummer im Array (ohne Kontrollpeptide), Peptidnummer- nach Mean geordnetes Peptid, Mean- SI-Einheit von Genspotter, Fmean- normalisierte Mean–Werte, min- Minimum und max- Maximum der gesamten Messwerte.

Peptid

Peptidnummer

Sequenz

Mean

Fmean

min

max

1325

1

KRRAPPPVPKKPSSR

3660

1.000

267

3660

1326

2

PKRRAPPPVPKKPSS

3544

0.966

2934

3

KTKQQKPAIPQKKSF

3284

0.889

1331

4

RAPPPVPKKPSSRIA

2822

0.753

1252

5

RPPRPPPKPLHLRTE

2695

0.716

2231

6

KDKKTKPTPPPKPSH

2505

0.660

2201

7

FPPKRKPLLRPQRSD

2240

0.581

2227

8

DKKTKPTPPPKPSHL

2229

0.578

1254

9

KDKSRPPRPPPKPLH

2106

0.542

2698

10

STKKPRPPVKSKPKH

2105

0.542

2228

11

TKPTPPPKPSHLKPK

2087

0.537

1330

12

RPKRRAPPPVPKKPS

2000

0.511

885

13

KNRKNLPTIPIRLSG

1981

0.505

2312

14

GSKSGPPPRPKKPST

1976

0.504

193

15

LKPPIGRPPKFPKSP

1913

0.485

1251

16

DKSRPPRPPPKPLHL

1867

0.472

151

17

KKAPPPVVKPKPRNF

1841

0.464

1729

18

NMLKKKPLKKPLKRF

1793

0.450

1547

19

LKHGWKPLRPIKLIS

1742

0.435

2933

20

AAHKTKPSIPPKKVE

1650

0.408

Tab. 23: Datensatz Abp1-SH3

Peptid

Peptidnummer

Sequenz

Mean

Fmean

min

max

714

1

PALPSLPPPPLLNVD

1150

1.000

271

1150

322

2

APKHAPPPVPNETDN

1119

0.964

1103

4

IPSRPAPKPPSSASA

1080

0.920

640

5

APNRIPPKVPVINDN

1029

0.862

Peptid

Peptidnummer

Sequenz

Mean

Fmean

min

max

888

6

AKDLIVPRRPEWNEG

1001

0.830

42

7

SEMSNSPQIPKKKVK

933

0.753

1102

8

ANGKFIPSRPAPKPP

930

0.750

2358

9

VFQFQMPTTPISTKM

898

0.713

12

10

AVDKIMPPTPAKKVE

896

0.711

545

11

KRPDMPPPSIIPRKN

893

0.707

929

12

IRMPSNPALPKKLLN

861

0.671

1292

13

PPSWKPPDLPIRLRK

846

0.654

779

14

KRMKALPKGPAALIN

835

0.642

1105

15

GKFIPSRPAPKPPSS

804

0.607

731

16

FKTREFMSLPQALET

795

0.597

411

17

RMKIMMSMEPKKPIT

783

0.583

1100

18

KFIPSRPAPKPPSSA

783

0.583

44

19

ADLPLPDLPPEPPTE

755

0.551

598

20

LTLLKMPEVPNSVSP

753

0.549

Tab. 24: Datensatz Myo5-SH3

Peptid

Peptidnummer

Sequence

Mean

Fmean

min

max

920

1

AATTSTPPLPRRRAT

2238

1.000

255

2238

1114

2

PLQSKIPMLPSRRTM

2022

0.891

2171

3

SSSSTPPTLPPRRIE

1301

0.528

153

4

APERAVPILPPRNNV

1145

0.449

2169

5

LKRITSPPLPPRADS

1067

0.410

888

6

AKDLIVPRRPEWNEG

1062

0.407

2170

7

QAPLDRPQLPPRQVV

1008

0.380

1351

8

KNWKLPPRLPHRAAQ

981

0.366

1719

9

ANNQGPPNLPARDKS

951

0.351

2865

10

GATNNAPTLPKRKNP

894

0.322

2276

11

AKRVAPPPLPNRQLP

854

0.302

1292

13

PPSWKPPDLPIRLRK

706

0.227

214

14

LPMNIQPDLPPRKIM

694

0.221

312

15

RSSAAPPPPPRRATP

649

0.199

311

16

SRSSAAPPPPPRRAT

618

0.183

2602

17

QQNRPLPQLPNRNNR

617

0.182

378

18

ATKSASPTLPTRRSR

603

0.175

1239

19

AERNYAPRLPRRETS

586

0.167

2520

20

DDEDVPPQLPTRTKS

563

0.155

Tab. 25: Datensatz Rvs167-SH3

Peptid

Peptidnummer

Sequence

Mean

Fmean

min

max

2928

1

SSSSSPPPLPTRRDH

2953

1.000

255

2953

2520

2

DDEDVPPQLPTRTKS

2595

0.867

2518

3

EEEEEHPPLPARRKS

2439

0.809

2247

4

ISNFVPPNLPMRRFK

1814

0.578

2828

5

VATSTSPKLPPRGKQ

1613

0.503

2858

6

VQPTAAPATPPRHIS

1586

0.493

2169

7

LKRITSPPLPPRADS

1580

0.491

1808

8

TTNRGPPPLPPRANV

1454

0.444

2865

9

GATNNAPTLPKRKNP

1428

0.435

2815

10

NPLPKEPRLPKRKVA

1117

0.319

1114

11

PLQSKIPMLPSRRTM

1080

0.306

2602

12

QQNRPLPQLPNRNNR

1077

0.305

2171

13

SSSSTPPTLPPRRIE

1068

0.301

1239

14

AERNYAPRLPRRETS

1000

0.276

1719

15

ANNQGPPNLPARDKS

945

0.256

173

16

VQQDSLPKLPFRSWG

916

0.245

2929

17

DGNEEKPLLPTRPNK

890

0.235

310

18

EAEEAAPQLPSRSSA

855

0.222

2170

19

QAPLDRPQLPPRQVV

789

0.198

2096

20

SNNSPLPVLPRRIST

786

0.197

Tab. 26: Datensatz Yhr016-SH3

Peptid

Peptidnummer

Sequence

Mean

min

max

Fmean

2231

1

KDKKTKPTPPPKPSH

8412

270

8412

1.000

1326

2

PKRRAPPPVPKKPSS

6665

0.785

888

3

AKDLIVPRRPEWNEG

6012

0.705

1325

4

KRRAPPPVPKKPSSR

5705

0.668

1331

6

RAPPPVPKKPSSRIA

4014

0.460

2228

7

TKPTPPPKPSHLKPK

3643

0.414

2105

8

MTNLRKPSAPKRMSS

3227

0.363

2934

9

KTKQQKPAIPQKKSF

2620

0.289

2698

10

STKKPRPPVKSKPKH

2606

0.287

1252

11

RPPRPPPKPLHLRTE

2512

0.275

2312

12

GSKSGPPPRPKKPST

2469

0.270

1330

13

RPKRRAPPPVPKKPS

2467

0.270

2201

14

FPPKRKPLLRPQRSD

2019

0.215

2587

15

RRGPAPPPPPHRHVT

1921

0.203

885

16

KNRKNLPTIPIRLSG

1750

0.182

466

17

RPSPWLPSKPNSYHP

1682

0.173

1251

18

DKSRPPRPPPKPLHL

1665

0.171

1294

19

SSISRKPPIPAKQHV

1620

0.166

2047

20

RMHSRPLVATMLKHW

1587

0.162

Tab. 27: Datensatz Regenerierung Abp1-SH3

Spot

Sequence/Abp1

Mean

Spot

Sequence/Myo5

Mean

Spot

Sequence/Rvs

Mean

Spot

Sequence/Yhr

Mean

1

LASDLIVPRR

1756

1

LASDLIVPRR

2367

1

LASDLIVPRR

1118

1

LASDLIVPRR

1203

2

LASDLIVPRR

1873

2

LASDLIVPRR

1997

2

LASDLIVPRR

1651

2

LASDLIVPRR

686

3

LASDLIVPRR

1446

3

LASDLIVPRR

2014

3

LASDLIVPRR

1500

3

LASDLIVPRR

1402

4

LASDLIVPRR

1369

4

LASDLIVPRR

2506

4

LASDLIVPRR

1589

4

LASDLIVPRR

2067

5

LASDLIVPRR

1259

5

LASDLIVPRR

2533

5

LASDLIVPRR

1557

5

LASDLIVPRR

972

41

LASDLIVPRR

2710

41

LASDLIVPRR

2374

41

LASDLIVPRR

2907

41

LASDLIVPRR

1786

42

LASDLIVPRR

1857

42

LASDLIVPRR

3691

42

LASDLIVPRR

3336

42

LASDLIVPRR

3276

43

LASDLIVPRR

2017

43

LASDLIVPRR

3210

43

LASDLIVPRR

3762

43

LASDLIVPRR

3262

44

LASDLIVPRR

2146

44

LASDLIVPRR

3662

44

LASDLIVPRR

4184

44

LASDLIVPRR

3277

45

LASDLIVPRR

2243

45

LASDLIVPRR

3738

45

LASDLIVPRR

4339

45

LASDLIVPRR

2856

3011

LASDLIVPRR

2134

3011

LASDLIVPRR

1664

3011

LASDLIVPRR

1794

3011

LASDLIVPRR

3107

3012

LASDLIVPRR

3312

3012

LASDLIVPRR

1559

3012

LASDLIVPRR

2010

3012

LASDLIVPRR

1863

3013

LASDLIVPRR

2499

3013

LASDLIVPRR

1481

3013

LASDLIVPRR

2159

3013

LASDLIVPRR

2244

3014

LASDLIVPRR

2489

3014

LASDLIVPRR

1592

3014

LASDLIVPRR

2569

3014

LASDLIVPRR

2353

3015

LASDLIVPRR

2545

3015

LASDLIVPRR

1914

3015

LASDLIVPRR

2078

3015

LASDLIVPRR

2284

min

1259

min

1481

min

1118

min

686

max

3312

max

3738

max

4339

max

3277

MW

2110

MW

2420

MW

2437

MW.

2176

Tab. 28: Datensammlung Markierungspeptide von SH3-Domänen Abp1, Myo5, Rvs167, Yhr016

Spot 1-21

Spot 22-36

Spot 37-55

Spot 56-60

ERPKRRAPPPVPKKP

ERPKRRAPP

ERPKRRA

ERPKR

ERPKRRAPPPVPKK

RPKRRAPPP

RPKRRAP

RPKRR

RPKRRAPPPVPKKP

PKRRAPPPV

PKRRAPP

PKRRA

ERPKRRAPPPVPK

KRRAPPPVP

KRRAPPP

KRRAP

RPKRRAPPPVPKK

RRAPPPVPK

RRAPPPV

RRAPP

PKRRAPPPVPKKP

RAPPPVPKK

RAPPPVP

: RRAPPPVPKKP

ERPKRRAPPPVP

APPPVPKKP

APPPVPK

:PKRRAPPPVPK

RPKRRAPPPVPK

ERPKRRAP

PPPVPKK

PKRRAPPPVPKK

RPKRRAPP

PPVPKKP

KRRAPPPVPKKP

PKRRAPPP

ERPKRR

ERPKRRAPPPV

KRRAPPPV

RPKRRA

RPKRRAPPPVP

RRAPPPVP

PKRRAP

PKRRAPPPVPK

RAPPPVPK

KRRAPP

KRRAPPPVPKK

APPPVPKK

RRAPPP

RRAPPPVPKKP

PPPVPKKP

RAPPPV

ERPKRRAPPP

APPPVP

RPKRRAPPPV

PPPVPK

PKRRAPPPVP

PPVPKK

KRRAPPPVPK

PVPKKP

RRAPPPVPKK

RAPPPVPKKP

Tab. 29: Längenanalyse: Ligand: ERPKRRAPPPVPKKP Myo5-SH3/ Abp1-SH3

Spot 1-21

Spot 22-36

Spot 37-55

Spot 56-66

VQQDSLPKLPFRSWG

VQQDSLPKL

VQQDSLP

VQQDS

VQQDSLPKLPFRSW

QQDSLPKLP

QQDSLPK

QQDSL

QQDSLPKLPFRSWG

QDSLPKLPF

QDSLPKL

QDSLP

VQQDSLPKLPFRS

DSLPKLPFR

DSLPKLP

DSLPK

QQDSLPKLPFRSW

SLPKLPFRS

SLPKLPF

SLPKL

QDSLPKLPFRSWG

LPKLPFRSW

LPKLPFR

LPKLP

VQQDSLPKLPFR

PKLPFRSWG

PKLPFRS

PKLPF

QQDSLPKLPFRS

VQQDSLPK

KLPFRSW

KLPFR

QDSLPKLPFRSW

QQDSLPKL

LPFRSWG

LPFRS

DSLPKLPFRSWG

QDSLPKLP

VQQDSL

PFRSW

VQQDSLPKLPF

DSLPKLPF

QQDSLP

FRSWG

QQDSLPKLPFR

SLPKLPFR

QDSLPK

RVS167:SLPKLPFRS

QDSLPKLPFRS

LPKLPFRS

DSLPKL

YHR016: PKLPFRSG

DSLPKLPFRSW

PKLPFRSW

SLPKLP

SLPKLPFRSWG

KLPFRSWG

LPKLPF

VQQDSLPKLP

PKLPFR

QQDSLPKLPF

KLPFRS

QDSLPKLPFR

LPFRSW

DSLPKLPFRS

PFRSWG

SLPKLPFRSW

LPKLPFRSWG

Tab. 30: Längenanalyse: Ligand: VQQDSLPKLPFRSWG Rvs167-SH3/ Yhr016-SH3

Sequence

Mean-Abp1

Mean-Myo5

Sequence

Mean-Rvs167

Mean-Yhr016

LKPPIGRPPKFPKSP

1913

736

APERAVPILPPRNNV

1145

459

FSKMAKKLLPYKPHN

768

583

VQQDSLPKLPFRSWG

999

916

KMSRSPPRPPSLKII

778

559

LPMNIQPDLPPRKIM

694

657

TSKMLKPPKQRRPHS

642

700

ATKSASPTLPTRRSR

603

529

SKIRPTPRKPSRMAT

1456

520

PKFLNSPDLPERTKL

432

581

AKDLIVPRRPEWNEG

1508

1001

AERNYAPRLPRRETS

586

1000

KFIPSRPAPKPPSSA

807

783

DPNFLLPNLPMRTFK

407

507

GKFIPSRPAPKPPSS

736

804

PPSWKPPDLPIRLRK

706

553

ISRRRLPVIMHRLKM

505

461

STPTSGPPLLPPRNT

520

467

DKSRPPRPPPKPLHL

1867

464

SSSSTPPTLPPRRIE

1301

1068

ERPKRRAPPPVPKKP

1594

676

DDEDVPPQLPTRTKS

563

2595

PKRRAPPPVPKKPSS

3544

615

SSSSSPPPLPTRRDH

401

2953

RPKRRAPPPVPKKPS

2000

410

SDKKKRPPILMLHGL

471

411

NMLKKKPLKKPLKRF

1793

425

VMNRRKIAMPKRRMA

464

422

MTNLRKPSAPKRMSS

693

501

VRTRRRPPPPPIPST

694

412

RRRPPPPPIPSTQKP

555

501

RRGPAPPPPPHRHVT

893

412

GVRLPAPPPPPRRGP

1043

434

NTMKKRPAPPSLPSL

633

448

RMVRRRPLRVQFSAR

587

492

LKPRKRMILPAWIKD

561

490

Tab. 31: Korrespondierende Liganden von Abp1-/ Myo5-SH3 und Rvs167-/ Yhr016-SH3

Puffersystem

Chemikalien

Menge

Anwendung des Puffers

1.SDS

Tris

62,5 mM

30 min bei 50°C schütteln

SDS

2%

3x10 min mit TBS waschen

Mercaptoethanol

100 mM

HCl

37% für pH6

2.SDS

siehe 1.

siehe 1.

siehe 1.

PBS 10 fach

NA2HPO4*12H20

33g/l

3x20 min

NAH2PO4*12H20

2,2g/l

NACl

87,7g/l

HCl

37 % für pH8

Puffersystem

Chemikalien

Menge

Anwendung des Puffers

TBS

NaCl

80g/l

3x20 min

KCl

2g/l

Tris

61 g/l

HCl

37 % für pH8

TBS 1 fach

TBS 10 fach

1:10

1x10 min

3.T-TBS

TBS 10 fach

1:10

Tween 20

0.05%

4. Tris pH 8,5

Tris-HCl

0,1M

1 mal

NaCl

2M

Acetat pH 4,5

NaAc

0,1

1 mal

NaCl

2M

3 mal wiederholen

5.Harnstoff

Harnstoff/Diethylamin

6M

10 min bei 50°C schütteln

Thioharnstoff

2M

3x10 min mit TBS waschen

SDS

1%

TBS 10 fach

NaCl

80 g/l

KCl

2g/l

Tris

61 g/l

HCl

37 % für pH8

Tab. 32: Puffer für die Regenerierung