| 59 |
Bei 47 Patienten, die histologisch und klinisch gesichert an einer Mycosis fungoides erkrankt waren, konnte retrospektiv in der Haut mit den TCR-γ-Konsensusprimern ein monoklonales Amplifikat nachgewiesen werden. Bei 3 Patienten (GL, PL und WA) konnte in beiden Allelen ein monoklonales Amplifikat gezeigt werden, so dass insgesamt 50 DNA-Sequenzen ermittelt wurden (s. Tab. 7). Von allen ermittelten Sequenzen betrug die mittlere Länge der N-Region 6,8 Basenpaare (Bp) (Median 6 Bp, xmax=18 Bp; xmin = 0 Bp). Der GC-Anteil an den N-Sequenzen betrug im Mittel 56,3% (Median 60%, xmax=80%, xmin=16,6%). Die Segmente Vγ2 und Vγ8 waren mit 50 bzw. 18% überdurchschnittlich repräsentiert, in 88% der Fälle wurde ein Rearrangement der VγI-Familie, in 12% Rearrangements der Familien VγII - IV gefunden (s. Abbildung 3).
| Abb. 3: Häufigkeit der Vg-Rearrangments | ||
| 60 |
Von 6 Patienten konnte mit Hilfe der TCR-β-Konsensusprimer ein monoklonales Amplifikat nachgewiesen werden. Da bei einem Patienten in beiden Allelen ein monoklonales Amplifikat gezeigt wurde, konnten daraus 7 Sequenzen ermittelt werden (s. Tab. 6). Von den ermittelten DNA-Sequenzen betrug die mittlere Länge der N-Region 14 Basenpaare (Median 10 Bp, xmax=30 Bp; xmin= 5 Bp). Hier betrug der GC-Anteil durchschnittlich 66,1% (Median 71,4%, xmax=80%, xmin=46%).
Tab. 6: TCR-β-Sequenzen, N-Sequenzen sind unterstrichen
|
Pat. |
Sequenz |
N-Region (Bp) |
GC-% insges. |
Primer |
Verlauf vorhand. |
|
|
GL |
Vb7s1 AGCCAAG (D2) CGG (N) AGAG CTCCTACGAG J2-7 |
7 |
71 |
- |
- |
|
|
HÖ |
Vb22s1 cagtgaa caggc ctatggct Jb1s2 |
5 |
80 |
+ |
- |
|
|
LO |
Vb13s3 TGCCAGC GGGAC TGAGCAGTT J2S1 |
5 |
80 |
+ |
+ |
|
|
RA |
Vb5s1 AGCTTGG GTGTCAGGAG GAACACTGAAG J1s1 |
10 |
60 |
+ |
- |
|
|
ZO |
Vb3S1 TTATAT GCGGTATGGCAGGGAGACTTCGAAAAAGTT CA J2S5 |
30 |
47 |
+ |
- |
|
|
MA |
Vb13s4 CAGCAG (N)CCCA(D2)GGGACTAGCGGG AGTTAC J2-4 |
16 |
75 |
- | ||
Es wurde versucht, für die patientenspezifischen TCR-Sequenzen spezifische Primer zu entwerfen.
| 61 |
Da für die N-Region von 11 Sequenzen mit einer Länge von 0 bis 2 Basenpaaren die Bildung eines spezifischen PCR-Produktes zwischen N-spezifischem Primer und DNA unwahrscheinlich war, wurde für diese auf die Entwicklung eines Primers verzichtet.
Für insgesamt 24 Sequenzen war das Design eines klonspezifischen Primers nicht möglich. Die N-Regionen dieser Sequenzen besassen im Mittel eine Länge von 6,5 Basenpaaren (Median 6 Bp; xmax= 18 Bp; xmin= 3 Bp). Der mittlere GC-Anteil betrug 54,3% (Median 60%, xmax= 80%, xmin= 16,6%). Davon zeigten von 5 Sequenzen die klonspezifischen Primer Schmelztemperaturunterschiede >10°C zu den Vγ-Primern. Die klonspezifischen Primer für 3 Sequenzen bildeten Primer-Dimere mit dG <-7,5 kcal/mol und mit einer Länge von mehr als 4 Basenpaaren, für eine Sequenz zeigten alle möglichen, klonspezifischen Primer falsche Bindungsstellen. Die Bildung von Haarnadelstrukturen war unbedeutend.
Tab. 7: TCR-γ-Sequenzen in Haut der MF-Patienten; N-Region ; + Primerdesign bzw. Verlauf möglich
|
Pat. |
Sequenz |
N-Reg. |
GC-% |
Primer |
Verl. vorhand. |
|
BÄ |
Vg8CTGGGATAGG GTTGTAGT TATAAGAAAC Jg1 |
8 |
37,5 |
- | |
|
BE |
Vg2CTGGGACGGG CGGTGGTACCAAC TATAAGAAAC Jg2 |
13 |
61,5 |
+ |
- |
|
BN |
Vg2CTGGGACGGG CCTGATGATTGGG TATAAGAAAC Jg1 |
13 |
54 |
+ |
- |
|
BO |
Vg3CTGGGACAGG CTCAGGT AATTATTATAAG Jg2 |
7 |
57 |
- | |
|
BR |
Vg4ACTGTGCCAC CTATT GAATTATTAT Jg1 |
5 |
20 |
- | |
|
DE |
Vg10TGCTGCGTGG GGAAGCATTAACGGGAG ATAAGAAACT Jg1 |
17 |
53 |
+ |
- |
|
FI |
vg2 ACCTGGGACG AGATACCGATAG ATAGTAGTG jgp2 |
12 |
42 |
+ |
+ |
|
FE |
Vg3TCTATTACTG TGCCCCNGNG GAATGGTTATA Jg1 |
10 |
70 |
- | |
|
FR |
Vg2CTGGGACGGG TATTATCAGA Jg2 |
0 |
- |
0 | |
|
GL |
Vg5CCTGGGACAG AACA ATTATAAGAA Jg2 |
4 |
25 |
- | |
|
HA |
Vg2CTGGGACGGG TACCTCGCCGGTAGGG TATTATAAGA Jg2 |
16 |
69 |
+ |
+ |
|
HE |
Vg2CTGGGACGGG CTTGAGAC TATAAGAAAC Jg1 |
8 |
50 |
+ |
+ |
|
HEI |
Vg2CTGGGACAGG CACC TTATAAGAAA Jg1 |
4 |
75 |
- | |
|
HN |
Vg8CTGGGATAGG AAACTC GAATTATTAT Jg1 |
6 |
33 |
- | |
|
HT |
Vg3TCTATTACTG TGCCCCTGTG GAATTATTAT Jg1 |
10 |
70 |
+ |
- |
|
HR |
Vg2CCCCTGGGAC TGG TATTATAAGA Jg1 |
3 |
66 |
- | |
|
HI |
Vg2CCTGGGACGG TATTATAAGA Jg1 |
0 |
- |
0 | |
|
HÖ |
VG8CTGGGATAGG CCTTAGC AAGAAACTCT Jg1 |
8 |
50 |
- | |
|
HRY |
Vg2CACCTGGGAG TGG TATTATAAGA Jg1 |
3 |
66 |
- | |
|
IV |
Vg3CCACCTGGGA GCCTA ATAAGAAACT Jg1 |
5 |
60 |
+ |
- |
|
JA |
Vg2CCTGGGACGG GA TTATTATAAA Jg1 |
2 |
50 |
0 | |
|
JE |
Vg5 TGGGACAG ATCTCCCTGG AAGAAACTCTTT JG2 |
10 |
60 |
+ |
- |
|
KR |
Vg8CTGGGATAGG GCAAAACAC ACTCTTTGGC Jg1 |
9 |
44 |
- | |
|
LA |
Vg2CTGGGATGGG CGAGG TATAAGAGAC Jg2 |
5 |
80 |
+ |
+ |
|
LE |
Vg8CCTGGGATAG AA ATTATATAAG Jg1 |
2 |
0 |
0 | |
|
LO |
Vg2CTGGGACGGG CC TTATTATAAG Jg1 |
2 |
100 |
0 | |
|
MH |
Vg8CCACCTGGGA TGAGC AATTATTATA Jg1 |
5 |
60 |
- | |
|
ML |
Vg5TTACTGTGCC CCTGTG GAATTATTAT Jg1 |
6 |
66 |
- | |
|
MN |
Vg2CTGGGACGGG GGCGGATG GAAACTCCTT Jg1 |
8 |
75 |
- | |
|
ME |
Vg2TGCCACCTGG AAATGT TATTATAAAA Jg1 |
6 |
17 |
- | |
|
MI |
Vg8CACCTGGGAT G GAATTATTAT Jg1 |
1 |
100 |
0 | |
|
MO |
Vg2CTGGGACGGG TATTATAAGA Jg1 |
0 |
- |
0 | |
|
MR |
Vg2CTGGGACGGG CC ATTATAATAA Jg1 |
2 |
100 |
0 | |
|
OT |
Vg2CTGGGACGGG CTTGAGAC TATAAGAAAC Jg1 |
8 |
50 |
+ |
- |
|
PA |
Vg8TGTGCCACTG TA GAATTATTAT Jg1 |
2 |
0 |
0 | |
|
PL |
Vg10TGCTGCGTGG GAGCC CCACTGGTTG JP1 |
5 |
80 |
- |
- |
|
RA |
Vg10TGCTGCGTGG GAGGGGT TTATTATAAG Jg1/2 |
7 |
71 |
- | |
|
RI |
Vg11ACTGTGCCTGCTGGATTAGGCACGTGGAAAGAAACTC Jg2 |
18 |
56 |
- | |
|
SE |
Vg2CCACCTGGGA TGAGCCGAACT ATTATTATAA Jg1 |
11 |
45 |
+ |
- |
|
SU |
Vg8ACTGTGCCAC TCTTTGGCAG Jg2 |
0 |
- |
0 | |
|
ST |
Vg4GTGCCACCTG CCTC GAATTATTAT Jg1 |
4 |
75 |
- | |
|
VI |
Vg2/7CACCTGGGAC AATGACCCCGGGT TAATTATTAT Jg2 |
13 |
62 |
+ |
- |
|
WA |
Vg2CACCTGGGAC TAAGC TATTATAAGA Jg1 |
5 9 |
40 |
- | |
|
WU |
Vg2CACCTGGGAC TGG TATTATAAGA Jg1 |
3 |
66 |
- | |
|
ZO |
Vg2CTGGGACGGG CCTCACGG TTATTATAAG Jg1 |
8 |
75 |
+ |
+ |
|
ZR |
Vg2CCTGGGACGG ATTATTATAA Jg1 |
0 |
- |
0 | |
|
ZW |
Vg7ACCTGGGACA TTCCC CTGGTTGGTT JP1/2 |
5 |
60 |
- | |
|
JU |
Vg8TGCCACCTGG AAATT TTATTATAAG Jg1 |
5 |
0 |
+ |
| 62 |
Für 15 Patienten konnte ein klonspezifischer TCR-γ-Primer und für 5 Patienten ein klonspezifischer TCR-β-Primer entwickelt werden. Hier betrug die mittlere Länge der N-Sequenzen bei den TCR-γ-Sequenzen 11,2Bp (Median 11 Bp; xmax= 17Bp; xmin= 5 Bp) und 15 Bp (Median 10 Bp; xmax= 30Bp; xmin=5 Bp) bei den TCR-β-Sequenzen. Der GC-Anteil lag bei durchschnittlich 59,5% (Median 60%, xmax= 80%, xmin= 41,6%) für die γ-Sequenzen und 57% (Median 60%; xmax= 80%, xmin=50%) für die β-Sequenzen. Der GC-Anteil der letzten 5 Basenpaare am 3´-Ende der Primer lag für die TCR-γ-Primer durchschnittlich bei 40% (xmax=80%, xmin=0%), für die TCR-β-Primer bei 63% (xmax= 80%; xmin= 60%).
Es konnte nur für 15 von 49 (30,6 %) TCR-γ-Sequenzen ein klonspezifischer Primer etabliert werden. Von 7 TCR-β-Sequenzen konnte für 5 ein Primer entworfen werden, was einem Anteil von 71,4 % entspricht.
Tab. 8: Sequenzen der klonspezifischen Primer mit PCR-Bedingungen, Mg-Konz.: MgCl2-Konzentration
|
Name |
Sequenz |
Typ |
Mg-Konz |
Annealing |
|
FI g |
vg2 ACCTGGGACGAGATACCGATAGATAGTAGTGattggat jgp2 |
gamma |
4 |
62°C |
|
HE g |
Vg2 CTGGGACGGGCTTGAGA
CTATAAGAAACTCTTTGG Jg 1/2 |
gamma |
1,5 | |
|
HA g |
Vg2 CTGGGACGGGTACCTCGCCGGTAGGAAGAaactctttgg Jg2 |
gamma |
2,5 |
58°C |
|
GL b |
Vb13s6 CCAGCAGCCCAGGGACTAGCGGGAGTTACAAGCAGTACT Jb2s4 |
beta |
4 |
62°C |
|
LA g |
Vg2CTGGGATGGGCGAGGTATAAGAGAC Jg2 |
gamma |
1,5 |
58°C |
|
ZO g |
Vg2 CACCTGGGACGGATTATTATAAGAAACTCTTTGG Jg 1/2 |
gamma |
2 | |
|
LO b |
Vb13s3 CTGTGCCAGCGGGACTGAGCAGTTcttcggcc J2S1 |
beta |
4 |
70°C |
|
RA b |
Vb5s1 AGCAGCTTGGGTGTCAGGAGGAACACTGAAGctatcttt J1s1 |
beta |
4 |
68°C |
|
ZO b |
Vb3S1 TTTATATGCGGTATGGCAGGGAGACTTCGAAAAAGTTCA J2S5 |
beta |
2,5 |
70°C |
| 63 |
Um die Spezifität der PCR zu erhöhen, wurde die MgCl2-Konzentration von 4 um jeweils 0,5mM bis minimal 1,5mM reduziert und, falls nicht ausreichend, die Annealingtemperatur um je 2°C erhöht, bis sich im Agarosegel ein PCR-Produkt nur in der gewünschten Probe mit der erwarteten Produktlänge darstellte. Die Primer und PCR-Bedingungen sind in Tab. 8) dargestellt.
Zur Spezifitätsprüfung wurden von zwei MF-Patienten Produkte aus der Konsensus-PCR kloniert. Es wurden 20 Klone aufgenommen, 14 von Patient ZO und 6 von Patient BÄ, und die DNA jedes Klons in zwei Fraktionen (A und B) aliquotiert. Fraktion A wurde in einer PCR mit dem für Patient ZO klonspezifischen Primer reamplifiziert. Da durch die Klonierung neben der Generierung von DNA mit dem klonalen auch die eines polyklonalen Rearrangements möglich war, wurden die Ergebnisse der klonspezifischen PCR mittels direkter Sequenzierung von Fraktion B überprüft. Beim Vergleich der Ergebnisse konnte in 18 von 20 Fällen (90%) eine Übereinstimmung festgestellt werden. In 2/20 Fällen zeigte die klonspezifische PCR ein positives Ergebnis, obwohl die monoklonale DNA bei der Sequenzierung nicht nachgewiesen wurde (Tab. 9).
Tab. 9: Spezifitäts-Nachweis: Klonspez. Primer Zl 1, Einzelzell-PCR- F.Z.Zellen 1,2,3,16,18, 20, 22-30 Zellen ohne Einzelzell-PCR-Produkt, Klon-spez.PCR negativ, *0,6 dNTP/2mM MgCl2
|
Zelle |
Sequenz direkt |
Klon |
Klonspez. PCR °C |
Sequenz kloniert |
||||
|
58 |
59 |
60 |
61 |
*58°C | ||||
|
4 |
CCTCACGG |
1 |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ | |
|
5 |
CCTCACGG |
1 |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ | |
|
6 |
CCTCACGG |
1 |
+ |
+ |
+ | |||
|
10 |
CCTCACGG |
1 |
+ | |||||
|
11 |
CCTCACGG |
1 |
+ |
+ |
+ | |||
|
12 |
TAAGGG |
+ |
+ |
(+) |
- |
- |
TAAGGG |
|
|
13 |
AAAGAGGC |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
AAAGAGGC |
|
|
14 |
CCTCACGG |
1,2 |
+ |
+ |
+ |
CCTCACGG |
||
|
TAAAGAGGCG |
TAAAGAGGCG |
|||||||
|
19 |
CCtcaCGG |
1,2 |
+ |
+ |
+ |
CCTCACGG |
||
|
TAAAGAGGCG |
TAAAGAGGCG |
|||||||
|
36 |
TAAAGAGG |
- |
- | |||||
|
42 |
CGA |
- |
- | |||||
|
44 |
CA |
- |
- | |||||
|
45 |
CCTTC |
- |
- | |||||
|
46 |
CAGGAaTTT |
- |
- | |||||
|
55 |
CAGGCCTC |
- |
- |
- | ||||
|
56 |
CAGGCCTC |
(+) |
- |
+ |
x |
|||
|
57 |
C |
+ |
- |
x |
||||
|
58 |
CAGTGGAAC |
- |
- | |||||
|
59 |
TTGG |
- |
- | |||||
|
17 |
1,2 |
+ |
CCTCACGG |
|||||
|
TAAAGAGGCG |
||||||||
| 64 |
Um die Sensitivität der klonspezifischen PCR zu prüfen, wurde für die Jurkat-Zelllinie ein spezifischer Primer entwickelt. Mit Hilfe einer 10fach-Verdünnungsreihe von Jurkat-DNA in aus PBMC eines gesunden Probanden gewonnener DNA konnte ein spezifisches Produkt bis zu einer Verdünnung von 10 Zellen in 106 Zellen, also 1 klonale in 105 polyklonalen Zellen als Hintergrund nachgewiesen werden (siehe Abbildung 4).
| Abb. 4: Klonale Jurkat-Zellen vor polyklonalem Hintergrund in oben angegebener Verdünnung, H2O: Negativprobe; Marker: Hinc III Lambda; klonspezifischer Primer: Ju | ||
Von 5 Patienten, für die ein klonspezifischer Primer entworfen werden konnte, waren mehr als 5 Blutproben im Verlauf vorhanden. Diese Blutproben wurden in einer klonspezifischen PCR quantifiziert.
| 65 |
Bei 4 Patienten konnte mit Hilfe der klonspezifischen Primer die klonale Sequenz aus der Haut auch in den Blutproben detektiert werden.
1. Bei Patient FI (s. Tab. 10) wurden 11 Blutproben aus einem Zeitraum von 53 Monaten untersucht. Mittels PCR mit Konsensusprimern konnte in keiner der Proben ein monoklonales Amplifikat gefunden werden, mittels klonspezifischer PCR neben der Blutprobe bei Erstdiagnose 02/1997 in neun weiteren Proben. Zum Zeitpunkt der kompletten Remission 05/1997 war die Detektion des monoklonalen Rearrangements im Blut nicht möglich.
Tab. 10: Patient FI: Ergebnisse der Routine-PCR, klonspezifischen PCR und Quantifizierung im LightCycler im Vergleich. PCR-TGGE: Ergebnisse der Routine-PCR mit TGGE, poly: polyklonal, mono: monoklonal, bi: biklonal; sq TuZ: semiquantitative Abschätzung im Agarosegel nach klonspez. PCR, Grad 0 bis +++; % TuZ: im LightCycler bestimmter Anteil an Tumorzellen im Blut, Therapie: bis zur Blutabnahme erhaltene Therapie
|
Number |
R-Nr |
PCR-TGGE |
Sq. TuZ |
% TuZ |
Verlauf |
Therapie |
|
02/97 |
5611 |
poly |
+ |
0,000 |
TNM IIa |
0 |
|
05/97 |
5867 |
poly |
0 |
1,860 |
Regredienz |
PUVA / IFN / Steroid |
|
08/97 |
6142 |
poly |
+ |
0,780 |
komplette Remission |
dto. |
|
01/98 |
6617 |
poly |
(+) |
2,135 |
dto. |
0 |
|
07/98 |
7371 |
poly |
+ |
0,000 |
Rezidiv |
0 |
|
11/98 |
7869 |
poly |
+ |
8,800 |
komplette Remission |
Steroid |
|
03/99 |
8332 |
poly |
+ |
2,088 |
Rezidiv |
PUVA |
|
12/99 |
9521 |
poly |
+ |
5,245 |
Rezidiv |
Steroid |
|
04/00 |
10464 |
poly |
+ |
0,905 |
Progressive Disease |
Steroid |
|
04/01 |
20413 |
poly |
+ |
1,530 |
komplette Remission |
0 |
|
07/01 |
20865 |
poly |
+ |
1,113 |
Rezidiv |
0 |
| 66 |
2. Bei Patient GL (s. Tab. 11) wurden 17 Blutproben aus einem Zeitraum von 38 Monaten getestet. Mittels Konsensusprimern konnte in 4, mittels klonspezifischer PCR in 12 Proben ein monoklonales Rearrangement ermittelt werden. Von der Erstdiagnose 12/1997 bis 01/1999 konnte mit Ausnahme vom Mai 1998 während progredienter Erkrankung durch keine der Methoden ein monoklonales Amplifikat gezeigt werden, im Mai 1998 war mittels klonspezifischer PCR ein monoklonales Rearrangement detektierbar. Ab 02/1999 bis 05/1999 war nur mit Hilfe der klonspezifischen Methode Monoklonalität, ab 10/1999 waren auch mit den Konsensusprimern ein mono- bzw. biklonales Amplifikat sowohl im Tumorstadium als auch während Remission nachweisbar.
3. Bei Patient LO (s. Tab. 12) wurden über einen Zeitraum von 43 Monaten 14 Blutproben untersucht, wobei in keiner der Proben mit Hilfe der Konsensusprimer ein monoklonales Amplifikat gezeigt werden konnte. Neben der Erstdiagnose 11/1997 konnte mittels klonspezifischer PCR in neun weiteren Proben das klonale Rearrangement bei sowohl re- als auch progredienter Erkrankung nachgewiesen werden.
4. Bei Patient ZO (s. Tab. 13) wurden 10 Proben über eine Zeit von 17 Monaten überprüft, in zwei Proben wurde mit Hilfe der Konsensusprimer ein monoklonales Amplifikat nachgewiesen. Neben der Erstdiagnose 12/1997 wurde mittels klonspezifischer PCR in den 4 weiteren Blutproben bis 01/1999 das klonale Rearrangement gezeigt, in den übrigen war dies nicht möglich.
| 67 |
Mit Hilfe der PCR mit Konsensusprimern wurde bei den 4 Patienten nur in 6/52 Blutproben die klonale Sequenz nachgewiesen, mit den klonspezifischen Primern war dies in 39/52 dieser Fälle möglich (siehe Tabelle 10,11 und 12). Bei den letztgenannten konnte eine Verlaufskontrolle der im Blut zirkulierenden klonalen Zellen mittels Real time-PCR vorgenommen werden.
In den Blutproben von Patient RA konnte die β-Sequenz aus der Haut nur bei Erstdiagnose nachgewiesen werden. In den restlichen Blutproben war die Sequenz mit den klonspezifischen Primern nicht nachweisbar und somit eine Quantifizierung im Verlauf nicht möglich.
Die Produktmenge der klonspezifischen PCR wurde im Agarosegel mittels einer Einteilung von null über „+“ bis „+++“, d.h. von wenig über mittel bis viel Produkt semiquantitativ abgeschätzt.
| 68 |
Tab. 11: Patient GL: Ergebnisse Routine-PCR, klonspezifische PCR und Quantifizierung im LightCycler im Vergleich. Erläuterungen siehe Tab. 10
|
Datum |
Name |
PCR-TGGE |
Sq. TuZ |
% TuZ |
Klinik |
Therapie |
|
12/97 |
6422 |
poly |
0 |
0,8 |
TNM IIB |
PUVA/IFN |
|
05/98 |
7144 |
poly |
+ |
0 |
Progressive Disease |
PUVA/IFN |
|
10/98 |
7625 |
poly |
0 |
0,0 |
Lk pos. |
Retinoide/PUVA/IFN |
|
11/98 |
7829 |
poly |
0 |
0,0 |
Progressive Disease |
HC-Vakzination |
|
01/99 |
8062 |
poly |
0 |
0,0 |
dto. |
dto. |
|
01/99 |
8158 |
poly |
0 |
3,0 |
dto. |
dto. |
|
02/99 |
8261 |
poly |
++ |
2,2 |
dto. |
dto. |
|
03/99 |
8394 |
poly |
++ |
4,7 |
dto. |
dto. |
|
04/99 |
8513 |
poly |
++ |
3,6 |
dto. |
dto. |
|
05/99 |
8592 |
poly |
++ |
5,6 |
dto. |
ECP/PUVA |
|
10/99 |
9282 |
mono |
++ |
5,1 |
dto. |
MTX |
|
12/99 |
9463 |
bi |
+++ |
29,5 |
T3↓/ T1/2↑ |
MTX |
|
01/00 |
10029 |
poly |
+ |
5,2 |
T3↑ |
PUVA |
|
03/00 |
10246 |
poly |
+ |
0,0 |
MTX |
|
|
11/00 |
11103 |
bi |
+++ |
91,1 |
Kompl. klin. Remission |
MTX / Targretin |
|
01/01 |
20036 |
poly |
+ |
21,0 |
dto. |
0 |
|
02/01 |
20187 |
bi |
++ |
8,0 |
dto. |
0 |
Bei 3 MF-Patienten konnte im LightCycler mittels Real time-PCR mit SYBR Green eine quantitative Verlaufsbeobachtung der klonalen, im Blut zirkulierenden Zellen durchgeführt werden.
| 69 |
Tab. 12: Patient LO: Vergleich der Ergebnisse der Routine-PCR mit denen der klonspezifischen PCR und Quantifizierung im LightCycler. Erläuterungen s. Tabelle 10
|
Datum |
Name |
PCR-TGGE |
Sq. TuZ |
% TuZ/TZ |
Klinik |
Therapie |
|
11/97 |
6340 |
poly |
+ |
0 |
TNM IIB |
PUVA/IFN |
|
06/98 |
7230 |
poly |
0 |
1,5 |
kompl. Remission |
PUVA/IFN |
|
03/99 |
8351 |
poly |
++ |
2,9 |
Rezidiv |
PUVA |
|
10/99 |
9276 |
poly |
++ |
1,4 |
part. Remission |
PUVA |
|
11/99 |
9391 |
poly |
+ |
0,0 |
Rezidiv |
0 |
|
02/00 |
10207 |
poly |
++ |
4,4 |
progr. Disease |
Steroid |
|
07/00 |
10772 |
poly |
0 |
0,0 |
dto. |
Steroid |
|
08/00 |
10861 |
poly |
0 |
0,0 |
dto. |
Hybridzell-Vakzination |
|
09/00 |
10945 |
poly |
+ |
4,3 |
dto. |
dto. |
|
10/00 |
11055 |
poly |
0 |
0 |
dto. |
dto. |
|
11/00 |
11132 |
poly |
+ |
5,0 |
dto. |
dto. |
|
02/01 |
20183 |
poly |
++ |
4,6 |
dto. |
PUVA/IFN |
|
04/01 |
20400 |
poly |
++ |
2,9 |
kompl. Remission |
PUVA/IFN |
|
06/01 |
20729 |
poly |
++ |
6,5 |
Rezidiv |
0 |
| 70 |
Fasst man die Ergebnisse der Real time-PCR zusammen, stellt man bei den 3 Patienten, für die eine Quantifizierung durchgeführt wurde, fest, dass sich der Anteil klonaler Zellen im Blut im Verlauf der Erkrankung ändert, bei den Patienten FI und LO maximal um den Faktor 10, bei Patient GL um den Faktor 100. Die mit Hilfe von Mehrfachbestimmungen erhaltenen Werte variieren mit einer mittleren Standardabweichung von 36,8% (xmin=0,96%, xmax=112,03%). Im LightCycler konnten Standardverdünnungen bis 103 Kopien/µl spezifisch detektiert werden. Mit Hilfe der Schmelzkurvenanalyse waren bei den Patienten FI und LO neben dem Peak der spezifischen Produkte ein Peak von unspezifischen Produkten nicht nachweisbar (s. Abb. 6). Da der β-Primer für GL unspezifische Produkte mit einem Peak bei 81°C in grosser Menge bildete (s. Abb. 8), wurde die Messtemperatur auf 83°C erhöht. Keine der Negativproben zeigte ein unspezifisches Produkt (s. Abb. 5).
| Abb. 5: Klonspezifische Real time–PCR Patient LO; Schwarz: Standard in zunehmender Verdünnung 1:10, mittelgrau: Blutproben LO; hellgrau: Negativproben | ||
| 71 |
| Abb. 6: Schmelzkurvenanalyse nach klonspezifischer PCR mit Blutprobe des Pat. FI im LightCycler | ||
In 37/52 Proben stimmten die Ergebnisse der klonspezifischen PCR im Agarosegel und der LightCycler-PCR überein: In 11/52 Fällen konnte weder mittels klonspezifischer PCR und Auftrennung im Agarosegel noch mittels LightCycler-PCR, in 26/52 Blutproben konnte mit Hilfe beider Methoden die klonale Sequenz detektiert werden. In 15 Fällen divergierten die Ergebnisse zwischen beiden Methoden. Die klonale Sequenz war in 11 Blutproben trotz Nachweises mittels Agarosegels durch die LightCycler-PCR nicht detektierbar, bei diesen war im Agarosegel immer eine Produktmenge von + bis (+) sichtbar. Bei 4/52 Proben war dies umgekehrt, hier wurden mittels LightCycler-PCR klonale Rearrangements mit einem Anteil von 0,5 bis 3,0% ermittelt (siehe Tabelle 10, 11 und 12).
Schätzt man den Anteil der klonalen Zellen im Blut semiquantitativ anhand der Bandenstärke im Agarosegel ab, stimmen 21/26 Blutproben mit den mittels Quantifizierung im LightCycler erhaltenen Daten überein, bei 5 Proben war der im LightCycler gemessene Anteil höher als im Agarosegel veranschlagt.
| 72 |
Tab. 13: Patient ZO, Vergleich Ergebnisse der Routine-PCR mit klonspezifischer PCR und LightCycler-Quantifizierung. (Erläuterungen siehe Tabelle 10)
|
Datum |
Name |
PCR-TGGE |
Sq. TuZ |
% TuZ |
Verlauf |
Therapie |
|
12/97 |
8711 |
poly |
(+) |
0 |
TNM Ia |
Externa |
|
05/98 |
9190 |
mono |
(+) |
0 |
Regredienz/ |
Externa |
|
10/98 |
9570 |
poly |
+ |
0 |
Neue Plaques |
Interferon / Bade-PUVA |
|
11/98 |
10302 |
poly |
(+) |
0 |
Inkompl. Remission |
dto |
|
01/99 |
10378 |
poly |
(+) |
0 |
dto. |
Externa |
|
01/99 |
10490 |
poly |
0 |
0 |
dto |
dto |
|
02/99 |
20058 |
mono |
0 |
0 |
3 Plaques |
Cortisonsalbe |
|
03/99 |
20978 |
poly |
0 |
0 |
dto |
dto |
|
04/99 |
347/02 |
poly |
0 |
0 |
dto |
dto |
|
05/99 |
348/02 |
poly |
0 |
0 |
Knotenbildg. |
Externa |
Bei Patient GL (s. Abb. 10) war der im LightCycler bestimmte Ausgangswert der zirkulierenden, klonalen Zellen 12/1997 während progredienter Erkrankung unter PUVA/Interferontherapie mit 0,8% niedrig und sank 10/1998 weiter auf 0% ab, zeitgleich mit dem Auftreten einer Lymphadenopathie. Im Anschluss kam es unter Hybridzellvakzinierung und Therapie mit extrakorporaler Photophorese und PUVA zu einem Anstieg der klonalen Zellen im Blut von 02/1999 bis 05/1999 bis auf 5,6%. Während einer MTX-induzierten Rückbildung der kutanen Tumoren 11/1999 kam es zu einem weiteren Anstieg auf 29,5%, während zum Zeitpunkt einer erneuten Progredienz 01/2000 der Anteil der klonalen Zellen auf 5,2% abfiel. Unter einer weiteren Methotrexattherapie kam es zunächst zu einem Abfall der zirkulierenden, klonalen Zellen auf 0%, während einer kompletten, klinischen Remission 11/2000 stiegen sie auf den Maximalwert von 91% an. Bei stabiler, klinischer Remission sank der Anteil der zirkulierenden Tumorzellen im weiteren Verlauf ab, der Patient verstarb 08/2001 an einer Sepsis mit 8% klonalen Zellen im Blut.
Bei Patient LO (s. Abb. 11) zeigten zwei zum Zeitpunkt der Remission 06/1998 nach PUVA/Interferon-Therapie und 03/1999 unter PUVA-Therapie entnommene Blutproben mit 1,4 und 2,9% nur einen geringen Unterschied der zirkulierenden klonalen Zellen. Während eines erneuten Rezidivs 12/1999 war das klonale Rearrangement im Blut nicht nachweisbar. Der Anteil stieg ab 03/2000 bis 03/2001 an, im gleichen Zeitraum war die Erkrankung progredient. Eine Ausnahme bildete die Zeit der Hybridzellvakzinierung, hier kam es zur Rückbildung eines Tumorknotens und zeitgleich zum Auftreten erneuter kutaner Manifestationen, klonale Zellen im Blut waren jedoch nicht mehr nachweisbar. Ihr Anteil stieg später unter PUVA-Therapie wieder auf 4,6%. Eine komplette, klinische Remission 03/2001 und ein späteres Rezidiv 05/2001 brachten nach einer leichten Abnahme einen maximalen Anstieg auf 6,5% klonale Zellen im Blut.
| 73 |
Bei Patient FI (s. Abb. 12) konnten im Blut während eines Rezidivs 02/1997 keine klonalen Zellen nachgewiesen werden, während klinischer Remission unter PUVA- und Interferontherapie stieg der Anteil zirkulierender, klonaler Zellen auf 2 bzw. 1% an und blieb während der kompletten Remission 01/1998 auf diesem Niveau. Zum Zeitpunkt eines erneuten Rezidivs 07/1998 waren die klonalen Zellen wiederum im Blut nicht nachweisbar, um während einer kompletten Remission unter Steroidtherapie 11/1998 auf den Maximalwert von 9% anzusteigen und während des nächsten Rezidivs 4/1999 wieder auf 2% zu fallen. Auch während des darauffolgenden Rezidivs 12/1999 sank der Anteil der im Blut vorhandenen monoklonalen T-Zellen trotz progredienten Krankheitsbildes 04/2000, blieb aber während der folgenden Remission 04/2001 und einem Rezidiv 07/2001 auf dem gleichen Niveau.
Betrachtet man bei Patient GL (s. Tab. 11 und Abb. 10) das Absinken der Tumorlast im Blut trotz Zunahme der Hauttumoren zwischen 12/1999 und 03/2000 und das klinische Bild einer kompletten Remission trotz maximalen Anteils an klonalen Zellen im Blut 11/2000, wird die Tendenz sichtbar, dass die Frequenz der klonalen Zellen im Blut bei Verbesserung des Hautbildes ansteigt und bei Verschlechterung absinkt. Ein weiteres Beispiel dafür ist Patient FI (s. Tab. 10 und Abb. 12), bei dem während der zwei Rezidive zu Beginn keine klonalen Zellen im Blut nachweisbar sind, während der Remissionen der Anteil der Tumorzellen aber ansteigt. Der maximale Anteil an klonalen Zellen zum Zeitpunkt einer kompletten Remission 10/1998 und ein Absinken des Anteils während des Rezidivs 04/1999 ist ein zusätzliches Beispiel. Bemerkenswert ist eine indirekte Korrelation von klinischem Bild und Anteil an zirkulierenden, klonalen Zellen nicht nur während den Phasen topischer Therapie, z.B. bei FI zwischen 07/1998 und 10/1998, sondern auch während der Applikation systemischer Therapieformen, z.B. die Chemotherapien mit MTX bei GL 09/1999 bis 12/1999 und 01/2000 bis 11/2000 und die Hybridzellvakzinierung 12/1998 bis 04/1999 beim gleichen Patienten.
Anders verhält es sich bei Patient LO (s. Tab. 12 und Abb. 11). Vergleicht man die Werte zum Zeitpunkt der kompletten Remissionen mit denen während der Rezidive, ist der Anteil der klonalen Zellen zum letztgenannten Zeitpunkt höher, was im Gegensatz zur vorher festgestellten Tendenz steht.
| 74 |
Werden die quantitativen Werte in Bezug zu klinischem Verlauf und Therapie gesetzt, lässt sich aber aufgrund der geringen Variation der Werte im Verlauf und der grossen Standardabweichungen höchstens eine Tendenz, jedoch keine sichere Korrelation feststellen.
Von 14 Patienten mit histologisch und klinisch gesicherter SPP wurden sowohl Haut- als auch Blutproben bei Erstdiagnose und vor Therapie retrospektiv mittels TCRγ-PCR-TGGE-Assays untersucht. Bei 9/14 Patienten konnte damit im Blut ein monoklonales Amplifikat nachgewiesen werden. In der Haut war bei keinem der Patienten Monoklonalität nachweisbar.
Das monoklonale TCR-γ-Rearrangement im Blut der 9 SPP-Fälle wurde sequenziert. Die N-Sequenzen aller Blutklone zeigten dabei eine mittlere Länge von 10,2 Bp (xmin= 2 Bp, xmax = 22 Bp), im Gegensatz zu 6,8 Basenpaaren bei den MF-Patienten. Der GC-Anteil betrug im Mittel 57,9% (Median= 57,8%; xmin= 0%; xmax= 100%).
| 75 |
Ein überdurchschnittlich häufiges Rearrangement wurde mit 44% für Vγ2 und mit 22 bzw. 33% für Vγ10 und 11 gesehen, VγII-IV wurden mit 55% häufiger als bei den MF-Patienten (13) rearrangiert (12%).
Für 6 Patienten war die Entwicklung eines N-spezifischen Primers möglich (siehe Tab. 14). Hier lag die Länge der N-Sequenzen im Mittel bei 14 Basenpaaren, der GC-Anteil bei 64,3% (Median= 61,3%, xmin= 41,6%, xmax= 100%). Für Patient BC und CZ wurde wegen einer N-Sequenz von 1 bzw. 3 Basenpaaren auf die Entwicklung eines Primers verzichtet. Die für die Patienten HL und HO entworfenen Primer waren nicht spezifisch, hier betrug die mittlere Länge der N-Sequenz 4,5 Bp, der GC-Anteil 23,1%.
Pro Patient wurden bei Erstdiagnose eine Haut- und Blutprobe und während des Follow-ups von 18 bis 47 Monaten 1 bis 8 weitere Blutproben entnommen.
| 76 |
Mit Hilfe der klonspezifischen Primer konnte das monoklonale Rearrangement in allen Blutproben der Patienten nachgewiesen werden. Anhand der PCR mit Konsensusprimern war dies nur in 18/20 Fällen möglich gewesen.
Bei keinem der 6 SPP-Patienten gelang es, die monoklonale Sequenz aus dem Blut auch in der Haut nachzuweisen (s. Abb. 7).
Obwohl das PCR-Produkt nochmals in einer geschachtelten PCR mit V seq und dem N-spezifischen Primer eingesetzt wurde, blieb ein Nachweis des monoklonalen Rearrangements in den Hautläsionen negativ (siehe Tab. 14).
| 77 |
Zur Beurteilung des Nachweises zirkulierender, klonaler Zellen bei SPP-Patienten ist eine Unterscheidung zwischen reaktiven und malignen Zellen notwendig. Zwar konnten in einigen MF-Fällen auch CD8+ Zellen als klonal proliferierend nachgewiesen werden, jedoch in der Mehrzahl der Fälle ist die maligne Zellfraktion bei MF CD4+ (92). Ausserdem konnte von Posnett et al. (84) die Entwicklung von Klonen bei CD8-positiven T-Zellen auch bei gesunden Probanden gezeigt werden. Deshalb wurden bei den Patienten SZ und HO die im Blut vorhandenen T-Zellen nach CD4/CD8-Expression sortiert, aus diesen Zellen DNA extrahiert und mit den klonspezifischen Primern untersucht. Bei beiden Patienten zeigte sich, dass die klonalen Zellen der CD4+ Fraktion zuzuordnen sind.
Tab. 14: Sequenzen und Ergebnisse der klonspezifischen PCR der SPP-Patienten
|
ID |
TCRγ PCR |
klonspezifische PCR |
Follow-up d |
|||||||||
|
Haut |
Blut |
Klonale TCRγ-Sequenz und |
Annealing temp. |
Blut |
Haut |
Haut nestedb |
CD4+ c |
CD8+ c |
TCRγ PCR |
klonspezifische PCR |
||
|
1 |
Wo |
p |
p |
0/2 | ||||||||
|
2 |
Kl |
p |
p |
0/1 | ||||||||
|
3 |
Sö |
p |
p |
0/3 | ||||||||
|
4 |
We |
p |
p |
0/1 | ||||||||
|
5 |
Sn |
p |
p |
0/8 | ||||||||
|
6 |
Cz |
p |
m |
Vg2- TGGGCAAATTA -Jg1 |
3/3 | |||||||
|
7 |
Be |
p |
m |
Vg11- GCTGGATTAGGTGGGGCGAGTGGAG -Jg2 |
64°C |
+ |
- |
- |
3/3 |
3/3 |
||
|
8 |
Bc |
p |
m |
Vg2- ACGGCTATA -Jg2 |
3/3 | |||||||
|
9 |
Hl |
p |
m |
Vg10- GTGGGAGCTGATATTATAAGAAA -Jg1 |
61°C |
ns |
8/8 | |||||
|
10 |
Ho |
p |
m |
Vg2- GGGTTAAAATTATTATAAGAAACTC -Jg2 |
61°C |
ns | ||||||
|
Vg2- CACCCATTCAGGGTAAGGGCAGT -Jg2 |
60°C |
++ |
- |
- |
+ |
- |
6/7 |
7/7 |
||||
|
11 |
Me |
p |
m |
Vg2- CAGGCCCCATTATAAGAAACACTTTG -Jg2 |
60°C |
+ |
- |
- |
3/4 |
4/4 |
||
|
12 |
Ri |
p |
m |
Vg11- GCTGGATTAGGCACGTGGAAAGAAA -Jg2 |
62°C |
++ |
- |
- |
1/1 |
1/1 |
||
|
13 |
Sf |
p |
m |
Vg10- GTGGGCCTAACCCATATACCACTG -Jg2 |
63°C |
++ |
- |
- |
1/1 |
1/1 |
||
|
14 |
Sz |
p |
m |
Vg10- GTGGGATGGGTGAGGGGCAACATT -Jg1 |
63°C |
++ |
- |
- |
+ |
- |
4/4 |
4/4 |
|
JM e |
Vg8- GAAATTTTATTATAAGAAACTCTTTGG -Jg2 |
60°C | ||||||||||
|
Vg11-GTCAGATCCTCACAGGGCGGGTTTAAG -Jg1 | ||||||||||||
|
Σ |
0/14 |
9/14 |
6/9 |
0/6 |
0/6 |
32/49 |
20/20 |
|||||
| © Die inhaltliche Zusammenstellung und Aufmachung dieser Publikation sowie die elektronische Verarbeitung sind urheberrechtlich geschützt. Jede Verwertung, die nicht ausdrücklich vom Urheberrechtsgesetz zugelassen ist, bedarf der vorherigen Zustimmung. Das gilt insbesondere für die Vervielfältigung, die Bearbeitung und Einspeicherung und Verarbeitung in elektronische Systeme. | ||
| DiML DTD Version 4.0 | Zertifizierter Dokumentenserver der Humboldt-Universität zu Berlin | HTML-Version erstellt am: 08.11.2006 |