Anhang

Tab. 28: Aminosäuresequenzen der Peptide ARP740

Peptid-Nummer

Aminosäursequenz

Peptid-Nummer

Aminosäursequenz

ARP740.1

ATEKLWVTVYYGVPVWKEATTT

ARP740.24

NGSLAEEEVVIRSVNFTDNA

ARP740.2

VPVWKEATTTLFCASDAKAY

ARP740.25

RSVNFTDNAKTIIVQLNTS

ARP740.3

LFCASDAKAYDTEVHNVWAT

ARP740.26

VQLNTSVEINCTR

ARP740.4

DTEVHNVWATHACVPTDPN

ARP740.27

VEINCTRPNNNTRKRIRIQ

ARP740.5

HACVPTDPNPQEVVLVNVTE

ARP740.28

NTRKRIRIQRGPGRAFVTIG

ARP740.6

PQEVVLVNVTENFDMWKNDMV

ARP740.29

RGPGRAFVTIGKIGNMRQA

ARP740.7

NFDMWKNDMVEQMHEDIISL

ARP740.30

KIGNMRQAHCNISRAKWNNT

ARP740.8

EQMHEDIISLWDQSLKPCVK

ARP740.31

HCNISRAKWNNTLKQIDSKL

ARP740.9

WDQSLKPCVKLTPLCVSLK

ARP740.32

LKQIDSKLREQFGNNKTIIF

ARP740.10

LTPLCVSLKCTDLKNDTNTN

ARP740.33

REQFGNNKTIIFKQSSGGDPE

ARP740.11

CTDLKNDTNTNSSSGRMIMEK

ARP740.34

KQSSGGDPEIVTHSFNCGGE

ARP740.12

SSSGRMIMEKGEIKNCSFNI

ARP740.35/6

GEFFYCNSTQLFNS

ARP740.13

GEIKNCSFNISTSIRGKVQK

ARP740.37

NSTWFNSTWSTEGSNNTEGS

ARP740.14

STSIRGKVQKEYAFFYKLDI

ARP740.38

TEGSNNTEGSDTITLPCRI

ARP740.15

EYAFFYKLDIIPIDNDTTSY

ARP740.39

DTITLPCRIKQIINMWQKVG

ARP740.16

IPIDNDTTSYSLTSCNTSVI

ARP740.40

KQIINMWQKVGKAMYAPPIS

ARP740.17

SLTSCNTSVITQACPKVSFE

ARP740.41

KAMYAPPISGQIRCSSNITG

ARP740.18

TQACPKVSFEPIPIHYCAPA

ARP740.42

GQIRCSSNITGLLLTRDGGNS

ARP740.19

PIPIHYCAPAGFAILKCNNK

ARP740.43

LLLTRDGGNSNNESEIFRLG

ARP740.20

GFAILKCNNKTFNGTGPCT

ARP740.44

NNESEIFRLGGGDMRDNWRS

ARP740.21

TFNGTGPCTNVSTVQCTHGI

ARP740.45

GGDMRDNWRSELYKYKVVKI

ARP740.22

VSTVQCTHGIRPVVSTQLLL

ARP740.46

ELYKYKVVKIEPLGVAPTKA

ARP740.23

RPVVSTQLLLNGSLAEEEVV

ARP740.47

EPLGVAPTKAKRRVVQREKR

Tab. 29: Ergebnisse der Transzytoseversuche mit unterschiedlichen Subtypen der HIV-1 Gruppe M und HIV-1 Gruppe O in Anwesenheit von Env362-420.

Transzytose (%)

Inhibierung (%)

HIV-1 Gruppe M Subtyp A Referenzisolat 11562/96

Viruskontrolle

6,6 x 105

Kontrollversuch

2,0 x 104

100

0

Peptid

6,5 x 103

33

67

HIV-1 Gruppe M Subtyp C Referenzisolat 484/97

Viruskontrolle

2,5 x 106

Kontrollversuch

1,0 x 105

100

0

Peptid

2,3 x 104

23

77

HIV-1 Gruppe M Subtyp DI Referenzisolat 3971/95

Viruskontrolle

7,1 x 106

Kontrollversuch

1,2 x 104

100

0

Peptid

7,8 x 103

65

35

HIV-1 Gruppe M Subtyp DII Referenzisolat 92UG024

Viruskontrolle

2,5 x 107

Kontrollversuch

5,2 x 102

100

0

Peptid

2,2 x 102

42

58

HIV-1 Gruppe M Subtyp F Referenzisolat 93BR020

Viruskontrolle

8,0 x 105

Kontrollversuch

4,2 x 104

100

0

Peptid

9,6 x 103

23

77

HIV-1 Gruppe M Subtyp G Referenzisolat ARP/173 RU570

Viruskontrolle

1,3 x 103

Kontrollversuch

2,3 x 101

100

0

Peptid

0

<43

>57

HIV-1 Gruppe O Referenzisolat HIV-1 CA-9

Viruskontrolle

4,3 x 106

Kontrollversuch

5,6 x 101

100

0

Peptid

2,0 x 101

36

64

Mittelwerte von mindestens drei Versuchen, Auswertung über HIV-1 Gruppe M und HIV-1 Gruppe O env-TaqMan™-PCR.

Tab. 30: Abkürzungsverzeichnis der Aminosäuren

Name

Dreibuchstabencode

Einbuchstabencode

Glycin

Gly

G

Alanin

Ala

A

Valin

Val

V

Leucin

Leu

L

Isoleucin

Ile

I

Cystein

Cys

C

Methionin

Met

M

Phenylalanin

Phe

F

Tyrosin

Tyr

Y

Tryptophan

Trp

W

Prolin

Pro

P

Serin

Ser

S

Threonin

Thr

T

Asparagin

Asn

N

Glutamin

Gln

Q

Asparaginsäure

Asp

D

Glutaminsäure

Glu

E

Histidin

His

H

Lysin

Lys

K

Arginin

Arg

R

Tab. 31: Studienkollektiv Verlaufsseren.

Studien-kollektiv

Patient

Extinktion im Peptid-ELISA

IgG-Konzentration [g/l]

Korrekturfaktor

Korrigierte Extinktion

AIDS

0,558

22,7

0,7

0,391

A

0,483

21,0

0,76

0,367

0,441

21,3

0,75

0,331

0,495

26,0

0,62

0,307

B

0,492

26,0

0,62

0,305

0,49

20,0

0,80

0,392

0,059

14,0

1,14

0,067

F

0

13,0

1,23

0

0,095

16,0

1,00

0,095

0,578

42,1

0,38

0,219

G

0,784

29,6

0,40

0,314

1,305

46,8

0,34

0,444

0,47

21,0

0,76

0,357

O

0,615

23,0

0,70

0,431

0,523

21,0

0,76

0,398

0,295

14,9

1,07

0,316

P

0,39

18,1

0,88

0,343

0,261

17,4

0,92

0,240

0,399

18,0

0,88

0,351

Q

0,483

19,0

0,84

0,406

0,515

22,0

0,73

0,376

0,278

U

0,671

35,0

0,46

0,309

1,017

34,0

0,47

0,478

0,356

24,0

0,67

0,239

V

0,763

18,1

0,88

0,671

0,591

19,1

0,84

0,496

0,806

24,3

0,66

0,532

b

0,486

23,7

0,68

0,331

0,720

22,9

0,67

0,482

Stadien-progression

0,203

C

0,520

32,1

0,50

0,260

0,888

62,0

0,26

0,231

0,149

15,8

1,01

0,150

E

0,458

17,9

0,89

0,408

15,2

1,05

0,38

22,0

0,72

0,274

H

0,198

24,0

0,67

0,133

0,564

29,0

0,55

0,310

0,590

25,1

0,64

0,378

I

0,638

36,9

0,43

0,274

0,432

29,2

0,55

0,238

0,62

20,0

0,80

0,496

M

0,322

21,0

0,76

0,245

0,404

25,0

0,64

0,259

0,513

23,0

0,69

0,354

W

0,360

19,0

0,84

0,302

0,255

22,0

0,73

0,186

0,027

18,5

0,86

0,023

Z

0,540

22,6

0,71

0,383

0,018

16,1

1,00

0,018

0,077

27,0

0,59

0,045

a

0,491

30,0

0,53

0,260

0,540

27,0

0,59

0,319

1,350

23,0

0,70

0,945

c

0,783

20,0

0,80

0,626

0,117

19,0

0,84

0,098

Latenz

0,119

17,6

0,90

0,107

N

0,546

26,7

0,60

0,328

0,404

22,8

0,70

0,283

0,332

15,4

1,04

0,345

R

0,372

15,2

1,05

0,391

0,109

15,8

1,01

0,110

Latenz

0,285

25,0

0,64

0,182

Y

0,206

0,206

9,4

1,70

0,650

0,099

21,0

0,76

0,075

e

0,765

23,0

0,67

0,507

0,441

25,3

0,63

0,278

LAS/ARC

0,177

K

0,657

25,0

0,64

0,420

0,748

25,0

0,64

0,479

0,642

29,6

0,54

0,347

L

0,644

30,0

0,53

0,341

0,736

31,0

0,52

0,382

0,407

23,3

0,67

0,273

X

0,254

18,1

0,88

0,224

0,723

21,2

0,75

0,542

Angabe der ermittelten Extinktionen im Peptid-ELISA, der IgG-Konzentration im Serum, der errechneten Korrekturfaktoren (bezogen auf 16g/l IgG) und der korrigierten Extinktionen. Daten entnommen aus Hardt 2000.

Tab. 32: Studienkollektiv dokumentierte Serokonversionen.

Patient

Proben-nummer

Abnahme nach x Wochen

Western Blot

ELISA

Stadium

Reaktivität im Peptid-ELISA

p24 Ak

gp41 Ak

gp120 Ak

gp160 Ak

1.

2.

  

A-E

A

0

(+)

-

-

-

-

-

I-II

-

B

2

+

-

-

-

-

-

II-III

-

C

3

+

(+)

(+)

(+)

+

+

III

-

D

7

+

(+)

-

-

+

+

IV

-

E

8

+

(+)

(+)

+

+

+

IV-V

-

a

1

0

+

-

(+)

+

+

+

IV

-

2

2

+

(+)

+

+

+

+

V

-

3

9

+

+

+

+

+

+

VI

-

4

15

+

+

+

+

+

+

VI

-

5

17

+

+

+

+

+

+

VI

-

6

22

+

+

+

+

+

+

VI

-

b

1

0

-

-

-

-

-

+

III

+

2

2

-

-

-

(+)

+

+

III

nb

3

4

(+)

-

(+)

+

+

+

IV

-

4

11

+

(+)

+

+

+

+

V-VI

+

5

17

+

+

+

+

+

+

V-VI

+

6

21

+

+

+

+

+

+

V-VI

(+)

7

25

+

+

+

+

+

+

V-VI

-

c

1

0

-

-

-

-

?

?

II-III

+

2

2

(+)

-

-

(+)

+

+

III

-

3

4

(+)

?

(+)

+

+

+

III-IV

-

4

8

+

-

+

+

+

+

IV

-

5

11

+

(+)

+

+

+

+

V

-

6

15

+

+

+

+

+

+

VI

-

7

19

+

+

+

+

+

+

VI

-

d

1

0

+

(+)

(+)

+

+

+

IV

(+)

2

2

+

(+)

+

+

+

+

V

+

3

9

+

(+)

+

+

+

+

V

-

4

13

+

(+)

+

+

+

+

V

-

5

18

+

+

+

+

+

+

VI

-

d

6

20

+

+

+

+

+

+

VI

-

7

28

+

+

+

+

+

+

VI

-

e

1

0

(+)

-

(+)

+

+

+

IV

+

2

2

(+)

-

(+)

+

+

+

IV

-

3

4

(+)

(+)

(+)

+

+

+

IV-V

-

4

9

+

+

+

+

+

+

V

+

5

14

+

+

+

+

+

+

V-VI

(+)

6

16

+

+

+

+

+

+

V-VI

+

7

18

+

+

+

+

+

+

V-VI

+

f

1

0

+

(+)

+

+

+

+

V-VI

-

2

2

+

+

+

+

+

+

V-VI

+

3

4

+

+

+

+

+

+

V-VI

-

4

10

+

+

+

+

+

+

VI

+

5

12

+

+

+

+

+

+

VI

+

6

14

+

+

+

+

+

+

VI

nb

7

16

+

+

+

+

+

+

VI

+

Angabe der Abnahmezeitpunkte, Ergebnisse der Western Blot- (Genelab® HIV-1 Western Blot) und ELISA- (1. BioRad HIV-ELISA, 2. Murex HIV-ELISA) Untersuchungen, Stadiumeinteilung nach Fiebig [Fiebig et al. 2003] und Reaktivität im Peptid-ELISA


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HTML-Version erstellt am:
13.03.2008