| Henklein, Petra: N-Arensulfonyl-Aminosäurechloride - Kupplung sterisch stark gehinderter Komponenten in der Peptidsynthese |
Humboldt-Universität zu Berlin
-Arensulfonyl-Aminosäurechloride - Kupplung sterisch stark gehinderter Komponenten in der Peptidsynthesezur Erlangung des akademischen Grades
doctor rerum naturalium (Dr. rer. nat.)
im Fach Chemie
eingereicht an der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät I der Humboldt Universität zu Berlin
Dekan der Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Fakultät
Prof. Dr. B. Ronacher
Gutachter:
1. Prof. Dr. Michael Bienert
2. Prof. Dr. Jürgen Liebscher
3. Prof. Dr. Klaus Neubert
eingereicht: 19.04.2000
Datum der Promotion: 24.07.2000
Obwohl die methodische Entwicklung der Peptidsynthese gewöhnlich eine automatisierte Herstellung erlaubt, sind für die Herstellung einer Reihe von Peptiden auch gegenwärtig Grenzen gesetzt. Einerseits kann eine im Verlauf der Kettenverlängerung auftretende Bildung intra- und /oder intermolekularer Wasserstoffbrücken zu einer begrenzten Solvatation und damit Zugänglichkeit der zu acylierenden Aminokomponente am Syntheseharz führen, andererseits kommt es beim Einbau sterisch anspruchsvoller Aminosäuren zu ungenügenden Acylierungsausbeuten. Urethangeschützte Aminosäurefluoride haben sich für den Einbau von alpha, alpha-Dialkylaminosäuren als geeignet erwiesen. Die reaktiveren urethangeschützten Aminosäurechloride sind zwar herstellbar, besitzen aber in Gegenwart einer Hilfsbase, die zum Abfangen der während ihrer Reaktion gebildeten HCl notwendig ist, eine zu geringe Stabilität (Oxazolonbildung, Abspaltung der Schutzgruppen). Erst die Verwendung von N(alpha)-Schutzgruppen, die keinen reaktionsfähigen Carbonylkohlenstoff enthalten, wie Arensulfonyl- Schutzgruppen, ermöglichen die volle Ausschöpfung der hohen Reaktivität der Aminosäurechloride. Mit Hilfe dieser Schutzgruppen gelang ein erster Vergleich der Reaktivität der Aminosäurechloride und -fluoride. Bei den durchgeführten Reaktionen wurde keine Stereomutation beobachtet. Unter Verwendung von Arensulfonylschutzgruppen war es erstmals möglich, zwei aufeinanderfolgende N-Alkyl-alpha, alpha-dialkylaminosäuren in Peptide einzubauen. Weiterhin konnten wir zeigen, daß derart geschützte Aminosäuren sich für in situ Aktivierungen mit Thionylchlorid eignen. Als Fänger für überschüssiges Aktivierungsreagenz wurden tertiäre Alkohole bzw. Amine eingesetzt. Arensulfonyl-geschützte Aminosäurechloride haben wir darüber hinaus erfolgreich in der Festphasenpeptidsynthese verwendet. In Kombination von Arensylfonyl-Schutz mit der Standard-Fmoc-Strategie gelang die Synthese eines biologisch aktiven Analogen des CRF, eines 41-mer Peptides mit einer eingefügten Tetrapeptidsequenz -Ala-MeAib-MeAib-Aib-.
Schlagwörter:
Aminosäurefluorid, Aminosäurechlorid, Arensulfonyl-Schutzgruppen, N-Alkyl-alpha, alpha-dialkylaminosäuren, Oxazolonbildung, Peptidsynthese, SPPS, CRF
Despite its wide field of application automatic peptide synthesis is still limited in certain cases. One of the limiting factors is the possibility of intra- or intermolecular hydrogen bond formation during the elongation of the peptide chain. This causes decreased solvation and thus reduced accessibility to the resin-bound amino component. Another limitation is the incorporation of sterically hindered amino acids that usually give rise to insufficient yields of acylation. Urethane protected amino acid fluorides have been shown suitable for the incorporation of alpha,alpha-dialkyl amino acids. Though the more reactive urethane protected amino acid chlorides can be readily synthesized, they do not possess the necessary stability in the presence of an auxiliary base that must be used for trapping of the hydrochloric acid formed during the reaction. Formation of oxazolons and deprotection of formerly protected functional groups would occur. Only the advent of protecting groups for the amino acid N-alpha that do not have a reactive carbonyl function - like arene sulfonyl groups - allowed to take full advantage of the high reactivity of the amino acid chlorides. These protecting groups enabled us to compare the reactivities of amino acid chlorides and fluorides for the first time. We didn't observe any stereo mutation in our experiments. The use of arene sulfonyl protecting groups permitted the consecutive incorporation of two N-alkyl-alpha,alpha-dialkyl amino acids into a peptide for the first time. Furthermore we could show, that amino acids protected in this way, are suitable for in situ activation with thionyl chloride. Tertiary alcohols and amines were used as scavenger for excessive activating reagent. Arene sulfonyl protected amino acids were also successfully used in solid phase peptide synthesis. By combining this protecting concept with the standard Fmoc approach we were able to synthesize a biologically active analogue of CRF, a peptide containing 41 residues into which we inserted the tetrapeptide Ala-MeAib-MeAib-Aib.
Keywords:
amino acid fluorid, amino acid chlorid, arene sulfonyl protecting group, N-alkyl-alpha, alpha-dialkyl amino acids, oxazolon, peptide synthesis, solid phase peptide synthesis, CRF
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Inhaltsverzeichnis | |
| Titelseite | N-Arensulfonyl-Aminosäurechloride - Kupplung sterisch stark gehinderter Komponenten in der Peptidsynthese |
| Abkürzungsverzeichnis | Abkürzungsverzeichnis |
| 1 | Einleitung |
| 1.1 | Bedeutung und Entwicklungstand der Peptidsynthese |
| 1.2 | Aminosäurehalogenide in der Peptidchemie |
| 1.2.1 | Fmoc-Aminosäurefluoride |
| 1.2.2 | Aminosäurechloride |
| 1.3 | Ziele der eigenen Arbeiten |
| 2 | Ergebnisse und Diskussion |
| 2.1 | Vergleich der Reaktivität von Fmoc-Aminosäurefluorid und -chlorid |
| 2.2 | Eigenschaften Arensulfonyl-geschützter Aminosäurehalogenide |
| 2.2.1 | Tosyl-geschützte Aminosäuren |
| 2.2.2 | Pbf-geschützte Aminosäuren |
| 2.2.3 | - und 4-Nitrobenzensulfonylaminosäuren |
| 2.2.4 | Dinitrobenzensulfonylaminosäuren |
| 2.2.5 | Synthese Arensulfonyl-geschützter Aminosäuren und ihrer Halogenide |
| 2.3 | Kupplungen mit Arensulfonyl-geschützten Aminosäurehalogeniden |
| 2.3.1 | Tosylaminosäurehalogenide |
| 2.3.2 | Pbf-Aminosäurehalogenide |
| 2.3.3 | NBS-Aminosäurehalogenide |
| 2.3.4 | DNBS-Aminosäurehalogenide |
| 2.3.5 | Nebenreaktionen bei Synthesen mit Arensulfonyl-geschützten Aminosäurechloriden |
| 2.4 | Abspaltung der Arensulfonylschutzgruppen |
| 2.4.1 | Abspaltung der Pbf-Schutzgruppe |
| 2.4.2 | Abspaltung der NBS-Schutzgruppe |
| 2.4.3 | Abspaltung der DNBS-Schutzgruppe |
| 2.5 | Synthesen mit in situ gebildeten Arensulfonyl-geschützten Aminosäurehalogeniden |
| 2.5.1 | Modelluntersuchungen zur in situ Säurechloridbildung |
| 2.5.2 | In situ Aktivierung von DNBS-Aminosäuren |
| 2.5.3 | Kupplung von in situ gebildetem DNBS-Val-Cl |
| 2.5.4 | Synthesen mit in situ gebildeten sterisch gehinderten DNBS-Aminosäurehalogeniden |
| 2.6 | Anwendung der Arensulfonyl-geschützten Aminosäurechloride in der Festphasensynthese |
| 2.6.1 | Synthesen mit o-NBS-MeAib-Cl |
| 2.6.2 | Beladungsbestimmungen |
| 2.6.3 | Synthese eines Urocortin-Analogons |
| 2.6.3.1 | CD-spektroskopische Untersuchungen |
| 2.6.3.2 | Untersuchungen zur biologischen Aktivität |
| 2.6.4 | Nebenreaktionen Arensulfonyl-geschützter Aminosäurehalogenide im Verlauf der SPPS |
| 2.7 | Untersuchungen zur Stereomutation von DNBS-Aminosäurehalogeniden |
| 2.7.1 | Einfluß der Abspaltbedingungen auf die Stereomutation |
| 2.7.2 | Untersuchungen zur Stereomutation bei der Kupplung von DNBS-Val-Cl |
| 3 | Zusammenfassung |
| 4 | Ausblick |
| 5 | Experimenteller Teil |
| 5.1 | Geräte |
| 5.2 | Chemikalien |
| 5.3 | Synthesen der Aminosäurederivate |
| 5.3.1 | Synthese der Aminosäuremethylester |
| 5.3.2 | Synthese von Referenzsubstanzen |
| 5.3.3 | Tosyl- und Pbf-Aminosäuren nach dem Schotten-Baumann-Verfahren |
| 5.3.4 | NBS- und DNBS-Aminosäuren |
| 5.3.5 | Arensulfonyl-geschützte Aminosäurefluoride |
| 5.3.6 | Arensulfonyl-geschützte Aminosäurechloride |
| 5.4 | Kupplungen der Arensulfonylaminosäurehalogenide |
| 5.4.1 | RSO2-Aib/MeAib-X an Aib-OMe |
| 5.4.2 | RSO2-Aib/MeAib-X an MeAib-OMe |
| 5.4.3 | Synthese von DNBS-Val-Val-OMe |
| 5.5 | Abspaltung der Arensulfonylschutzgruppe |
| 5.5.1 | Abspaltung der Pbf-Schutzgruppe |
| 5.5.2 | Abspaltung der NBS-Schutzgruppe |
| 5.5.3 | Abspaltung der DNBS-Schutzgruppe |
| 5.6 | Kupplungen mit in situ gebildeten Aminosäurechloriden |
| 5.6.1 | In situ Aktivierung am Essigsäuremodell |
| 5.6.2 | In situ Aktivierung von DNBS-Val-OH |
| 5.6.3 | IR-Untersuchungen zum Abfangen von SOCl2 mit t-BuOH |
| 5.6.4 | Kupplung mit in situ gebildetem DNBS-Val-Cl |
| 5.6.5 | Acylierungen mit in situ gebildeten, sterisch gehinderten Aminosäurechloriden |
| 5.7 | Festphasensynthesen |
| 5.7.1 | Harzsynthese von MeAib-Aib-Phe-Phe |
| 5.7.2 | Synthese eines Urocortin-Analoga |
| 5.7.3 | Harzkupplungen mit in situ gebildeten Aminosäurechloriden |
| 5.7.4 | Untersuchungen mit DNBS-Val-Cl/OH (Siehe Nebenreaktionen SPPS) |
| 5.8 | Untersuchungen zum Auftreten von Stereomutation |
| Bibliographie | Literaturverzeichnis |
| Danksagung | |
| Selbständigkeitserklärung | |
Tabellenverzeichnis | |
| Tab. 1: | Beispiele zur Chemosynthese von langkettigen Peptiden bzw. Proteinen |
| Tab. 2: | Vergleich der mit verschiedenen Methoden erzielten Ausbeuten für die Synthese von SG-Aib-Aib-OR |
| Tab. 3: | Überblick über die während der Arbeit synthetisierten Arensulfonyl-geschützten Aminosäuren |
| Tab. 4: | Ausbeuten von Acylierungen mit in situ gebildeten bzw. preformierten Aminosäurechloriden |
| Tab. 5: | Darstellung der für die CD-Untersuchungen verwendeten Peptide |
| Tab. 6: | Durch LC-MS-Untersuchungen gefundene Nebenprodukte bei der Harzsynthese |
| Tab. 7: | Ergebnisse der Untersuchungen zum Auftreten von Stereomutation bei Abspaltung der DNBS-Gruppe |
| Tab. 8: | Stereomutation für die Kupplung von DNBS-Val-Cl an Ala-NA |
| Tab. 9: | Reaktionsbedingungen für die Herstellung der Tosyl- und Pbf-Aminosäuren |
| Tab. 10: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten der Kupplung von RSO2-Aib/MeAib-X an Aib-OMe |
| Tab. 11: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten der Kupplung von RSO2-Aib-X an MeAib-OMe |
| Tab. 12: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten der Kupplung von RSO2-MeAib-X an MeAib-OMe |
| Tab. 13: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten für DNBS-Val-Cl + Val-OMe |
| Tab. 14: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten der in situ Aktivierung von DNBS-Val-Cl |
| Tab. 15: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten für die Kupplung mit in situ gebildetem DNBS-Val-Cl |
| Tab. 16: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten für die Kupplung mit in situ gebildetem DNBS-Aib/MeAib-Cl |
| Tab. 17: | Chemische Verschiebungen [ppm] für die Tetrapeptide Aib/MeAib-MeAib-Aib-Ala-NA |
| Tab. 18: | Reaktionsbedingungen für die Synthese des UEK-Analogons |
| Tab. 19: | Harzkupplung mit in situ gebildetem DNBS-Val-Cl am Harz |
| Tab. 20: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten für die Kupplung mit DNBS-Val-Cl |
| Tab. 21: | Reaktionsbedingungen und Ausbeuten für die Kupplung mit DNBS-Val |
| Tab. 22: | Reaktionsbedingungen für die Untersuchungen zur Stereomutation |
Abbildungsverzeichnis | |
| Abb. 1: | Beispiel für antibakteriell wirksame, , -Dialkylaminosäuren enthaltende Peptide; Aib=Aminoisobuttersäure, Api= 4-Aminopiperidin-4-carbonsäure |
| Abb. 2: | Syntheseschema für geschützte Aminosäurefluoride |
| Abb. 3: | Vergleich der Umsätze sterisch gehinderter Fmoc-Aminosäurefluoride an Aib-OMe [50] , [51] |
| Abb. 4: | Base-katalysierte Fmoc-Abspaltung |
| Abb. 5: | Kupplung von Fmoc-MeAib-F an Aib-OMe in DMF bei Einsatz verschiedener HCl-Fänger |
| Abb. 6: | Zerfall Z-geschützter Aminosäurechloride |
| Abb. 7: | Verlust der chiralen Integrität durch Oxazolonbildung |
| Abb. 8: | Geminaler Dialkyleffekt |
| Abb. 9: | Fragmentierung von Tosylaminosäurechloriden im wäßrig-alkalischen Milieu |
| Abb. 10: | Kupplung von a) Fmoc-Aib-X an Aib-OMe und b) Fmoc-Ala-X an MeAib-OMe in DCM mit BSA als HCl-Fänger |
| Abb. 11: | Im Rahmen der Arbeiten verwendete Arensulfonylschutzgruppen |
| Abb. 12: | Verschiedene Arensulfonylschutzgruppen |
| Abb. 13: | Schema der Schutzgruppenabspaltung durch nucleophile Substitution |
| Abb. 14: | Abspaltung der DNBS-Schutzgruppe |
| Abb. 15: | Arensulfonyl-geschützte Aminosäurefluoride am Beispiel von Tos-Aib-F a) IR-Spektrum; b) HPLC-Profil |
| Abb. 16: | Arensulfonyl-geschützte Aminosäurechloride am Beispiel von Tos-Aib-Cl a) IR-Spektrum; b) HPLC-Profil |
| Abb. 17: | Kupplungseffizienz von Tos-Aib-X an a) Aib-OMe (DCM) und b) MeAib-OMe (Toluen); unter Verwendung von DIEA |
| Abb. 18: | Massenspektrum des Rohpeptides Tos-Aib-MeAib-OMe |
| Abb. 19: | Kupplungseffizienz von RSO2-Aib-X an a) Aib-OMe (DCM) und b) MeAib-OMe (Toluen); als Base wurde DIEA verwendet |
| Abb. 20: | Vergleich der Kupplungsausbeuten für das Dipeptid Fmoc/Pbf-MeAib-Aib-OMe in DCM mit BSA (Fmoc) bzw. DIEA (Pbf) als HCl-Fänger |
| Abb. 21: | Vergleich des Raumbedarfes von Ala-Ala-OH und MeAib-MeAib-OH |
| Abb. 22: | Pbf-MeAib-MeAib-OMe a) 1H-NMR-Spektrum b) HPLC-Profil des gereinigten Peptides |
| Abb. 23: | Kupplungslösung o-NBS-MeAib-Cl + MeAib-OMe nach 2h |
| Abb. 24: | Kupplung von o-NBS-MeAib-Cl an MeAib-OMe in Abhängigkeit vom jeweiligen HCl-Fänger in DCM/Toluen |
| Abb. 25: | Einfluß der N -Schutzgruppe auf die Reaktion von RSO2-MeAib-Cl mit MeAib-OMe; die Reaktionen wurden in Toluen bzw. Toluen/DCM mit DIEA durchgeführt |
| Abb. 26: | Kupplungsausbeuten für das Dipeptid DNBS-Val-Val-OR a) mit BSA und b) mit DIEA |
| Abb. 27: | Vergleich der Umsätze für die Synthese von RSO2-Aib-MeAib-OMe mit DIEA (Tos) bzw. mit BSA (Pbf, o-NBS, DNBS) in Toluen |
| Abb. 28: | Kupplungseffizienz von RSO2-MeAib-Cl an MeAib-SGC mit der o-/p-NBS-Gruppe und der DNBS-Gruppe |
| Abb. 29: | Pbf-Amid |
| Abb. 30: | IR-Spektrum des bei der Reaktion gebildeten Nebenproduktes (NP) im Vergleich zu o-NBS-Amid |
| Abb. 31: | IR-Spektrum des bei der Synthese von Pbf-MeAib-MeAib-OMe isolierten symmetr. Anhydrides |
| Abb. 32: | Massenspektrum des Dipeptides MeAib-MeAib-OMe |
| Abb. 33: | Spaltung von Pbf-Aib-MeAib-OMe durch TFA |
| Abb. 34: | HPLC-Profile a) TFA + Pbf-Aib-MeAib-OMe sofort vermessen; RT (Pbf-Aib-O-TFA): 11,7min b) TFA + Pbf-Aib-MeAib-OMe, 24h in AN/H2O gelagert; RT (Pbf-Aib): 13,8min |
| Abb. 35: | In situ Herstellung von Essigsäurchlorid; 1eq. HAc+1eq. SOCl2+xeq. DIEA; 0.1M in DCM |
| Abb. 36: | In situ Herstellung von Essigsäurechlorid; 1eq. HAc + 1eq. SOCl2 + 0,5eq. Base, 0,1M in DCM; t=10’ |
| Abb. 37: | In situ Aktivierung von DNBS-Val-Cl |
| Abb. 38: | Säurechloridbildung mit 1eq. SOCl2, 30min |
| Abb. 39: | Ausbeuten der Säurechloridbildung mit Xeq. SOCl2, 10min, 45°C |
| Abb. 40: : | IR-spektroskopische Untersuchung der Reaktion von SOCl2 mit t-BuOH |
| Abb. 41: | Schematische Darstellung der Synthese von DNBS-Val-Val-OR durch in situ Aktivierung |
| Abb. 42: | Vergleich der Ausbeuten für die Synthese von DNBS-Val-Val-OR in DCM bzw. DCM/DMF, t=10min, c=0.3M |
| Abb. 43: | Allgemeines Syntheseschema für die Kupplung in situ gebildeter, sterisch anspruchsvoller Aminosäureschloride |
| Abb. 44: | Kupplungseffizienz von in situ gebildeten und preformierten DNBS-MeAib-Cl bzw. DNBS-Aib-Cl an Ala-NA |
| Abb. 45: | Umsatzvergleich für die Kupplung von DNBS-MeAib-Cl an Ala-NA mit X eq. Base |
| Abb. 46: | Kupplung von in situ gebildeten DBS-MeAib-Cl an Ala-NA, Aib-Ala-NA (30 min) bzw. an MeAib-Aib-Ala-NA (t = 4h) |
| Abb. 47: | Syntheseschema des Tetrapeptides |
| Abb. 48: | HPLC-Profil des gereinigten Tetrapeptides |
| Abb. 49: | Syntheseschema des Urocortinanalogons |
| Abb. 50: | CD-Spektren der untersuchten Peptide |
| Abb. 51: | Darstellung der biologischen Aktivität anhand der gemessenen EC50-Werte der Testosteronproduktion |
| Abb. 52: | Nebenreaktion während der Acetylierung; R = Aminosäureseitenkettenrest, R’ = Restpeptid am Harz |
| Abb. 53: | Abnahme der Beladung für die DNBS-Valin-Kupplung an verschiedenen Harzen |
| Abb. 54: | Austausch einer Nitrogruppe durch das angreifende Nucleophil |
| Abb. 55: | HPLC-Profil des vom Harz abgespaltenen Rohpeptides NH2-(Val)5-Lys-NH2 |
| Abb. 56: | HPLC-Profil des Rohpeptides NH2-(Val)4-Lys-OH, synthetisiert mit o-NBS-Val-Cl |
| Abb. 57: | HPLC-Profile von a) DNBS-D,L-Val-Ala-NA und b) D, L-Val-Ala-NA |
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HTML - Version erstellt am: Mon Sep 16 13:41:08 2002 |