Abbreviations

aa

amino acid

aa-tRNA

aminoacyl-transfer RNA

ABC transporter

ATP-binding cassette transporter

ACS medium

sucrose-ammonium citrate medium

Ap

ampicillin

APS

ammoniumpersulfate

ATP

adenosine-5'-triphosphate

BSA

Bovine Serum Albumin

cpm

counts per minute

DIG

digoxigenin

FAS

fatty acid synthase

Fig.

figure

h

hours

IM-HK

intramembrane-sensing histidine kinases

IPTG

isopropyl β-D-thiogalactoside

Km

kanamycin

LB

Luria-Broth

MALDI-TOF MS

matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry

min

minutes

mRNA

messenger RNA

MS

mass spectrometry

MU

Miller units

NRPS

nonribosomal peptide synthetase

OD

optical density

ORF

open reading frame

Pbmy, PyczE

promoter of the bmy operon, promoter of yczE

PCR

polymerase chain reaction

PKS

polyketide synthase

4'-PP cofactor

4'-phosphopantetheine cofactor

PPi

pyrophosphate

4'-PPTase

4'-phosphopantetheinyl transferase

Rap

response regulator aspartate phosphatase

rpm

rounds per minute

SDS

Sodiumdodecylsulfate

sec

seconds

TCS

two-component regulatory system

Tden, Tanneal, Text

denaturating, annealing and extension temperature

TEMED

N,N,N,N-Tetramethylethylendiamine

TRP

tetratricopeptide

X-Gal

5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-beta-D-galactopyranoside

Abbreviations for domains present on NRPSs, FASs and PKSs

A

Adenylation

ACP

acyl carrier protein

AT

Acyltransferase

C

Condensation

C-MT

C-Methyltransferase

Cy

Heterocyclization

DH

β-hydroxyacyl-ACP dehydratase

E

epimerization

ER

enoyl-ACP reductase

KR

ketoacyl-ACP reductase

KS

keto synthase

N-MT

N-Methyltransferase

PCP

peptidyl carrier protein

T

thiolation

TE

thioesterase

TE II

thioesterase II


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23.01.2007