Abkürzungsverzeichnis

ADE2	Selektionsmarker für die Hefe
AmpR	Ampicillin-Resistenzgen, Selektionsmarker für E. coli
ATP	Adenosin-Triphosphat
BiP	„binding to immunoglobulin precursors“, Protein der Hsp70-Familie
bp	Basenpaare
CF-1, -2	= CF-SEC61-I bzw. CF-SEC61-II, bezeichnet die SEC61-Gene aus dem Hund (Canis familiaris)
DAPI	4´,6-di-Amidino-2-Phenyl-Indoldihydrochlorid
dH2O	destilliertes Wasser
DMSO	Dimethylsulfoxid
dNTP	Desoxyribonukleotid-5´-Triphosphat
DTT	Dithiothreitol
E. coli	Escherichia coli, gram-negatives Enterobacterium
EDTA	Ethylendiamintetraessigsäure
eq	1 Äquivalent (eq) an Membranen ist definiert als 1 ml einer Membran-suspension mit einer Absorption von 50 bei 280 nm (OD280nm = 50)
ER	Endoplasmatisches Retikulum
EST	„expressed sequence tags“, meist im Rahmen von Genom-Sequenzierungs-projekten erhaltene cDNA-Fragmente, deren Sequenzen in Datenbanken (z.B. der NCBI-GenBank) gesammelt werden
FITC	Fluoresceinisothiocyanat
GAPs	GTPase-aktivierende Proteine
GTP	Guanosin-Triphosphat
Hepes	N-(2-Hydroxyethyl)piperazin-N´-(2-ethansulfonsäure)
HIS3	Selektionsmarker für die Hefe
HPRT	Hypoxanthin-Guanin-Phosphoribosyltransferase, konstitutiv exprimiertes Gen, hier eingesetzt als Referenzgen zum Vergleich der RNA-Mengen unterschiedlicher Präparationen
HS-1, -2	= HS-SEC61-I bzw. HS-SEC61-II, bezeichnet die humanen SEC61-Gene
Hsp70	70 kD-Hitzeschockprotein, Proteinfamilie mit Chaperon-Funktion; Vertreter dieser Familie sind beispielsweise DnaK und Kar2p/BiP
IP	Immunpräzipitation
Kar2p	Genprodukt des Karyogamie-Gens 2 in der Hefe; luminales ER-Protein und Mitglied der Hsp70-Proteinfamilie, Hefehomologes von BiP/GRP78, Homologie zu DnaK aus E. coli
kb	Kilobasenpaare
LEU2	Selektionsmarker für die Hefe
MM-1, -2	= MM-SEC61-I bzw. MM-SEC61-II, bezeichnet die SEC61-Gene aus der Maus (Mus musculus)
MCS	multi cloning site
NCBI	National Center for Biotechnology Information
nt	Nukleotid(e)
ODxy nm	Optische Dichte bzw. Absorption einer Lösung bei Wellenlänge xy nm.
OD600nm	Optische Dichte bei 600 nm; hier teilweise als Mengenangabe verwendet: 1 OD600nm Hefen entsprach bei dem verwendeten Photometer 1 x 107 haploiden Hefezellen
ORF	„open reading frame“, offenes Leseraster, kodierender Bereich eines Gens
PBS	„phosphate buffered saline“, Phosphat-gepufferte Salzlösung
PCR	„polymerase chain reaction“, Polymerase-Kettenreaktion
PEG	Polyethylenglykol
PI	Proteaseinhibitor, verwendet wurde ein Gemisch aus Leupeptin, PepstatinA und Chymostatin
PMSF	Phenylmethylsulfonsäurefluorid, Inhibitor von Serinproteasen
ppF	Präpro-alpha-Faktor, Sexualhormon aus S. cerevisiae, bestehend aus der prä-Sequenz (Signalsequenz), einem pro-Teil und vier identischen Kassetten, die den reifen alpha-Faktor enthalten.
ProOmpA	Vorläufer des Bakterienproteins A der äußeren Membran (precursor of outer membrane protein A), kein Membranprotein !
Q-Sepharose	Anionenaustauscher, modifiziert mit quartären Aminoethylgruppen
race	rapid amplification of cDNA ends, PCR-Methode zur Amplifizierung von 3´- oder 5´-Bereichen eines Gens
RN-1, -2	= RN-SEC61-I bzw. RN-SEC61-II, bezeichnet die SEC61-Gene aus der Ratte (Rattus norwegicus)
RT	Reverse Transkription
S	Svedberg-Einheit; Maß der Sedimentationsgeschwindigkeit eines Partikels im Gravitationsfeld
S. cerevisiae	Saccharomyces cerevisiae, eine einzellig wachsende Hefe
SDS	Natriumdodecylsulfat; ein Detergens, das stark an Proteine bindet und sie dabei denaturiert; Verwendung bei der Elektrophorese von Proteinen
SDS-PAGE	SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese; Verfahren zur Auftrennung von Proteinen nach ihrer Molmasse
Sec	Sec-Proteine bzw. Sec-Mutanten wurden in genetischen Screens auf Mutanten mit Defekten in der Sekretion gefunden
SP-Sepharose	Kationenaustauscher mit einer Sulfopropylgruppe
SR	SRP-Rezeptor, auch „docking protein“ genannt
SRP	Signalsequenz-Erkennungspartikel (signal recognition particle), Ribonucleoproteinkomplex
TCA	Trichloressigsäure
TE	Tris-EDTA
TetR	Tetracyclin-Resistenzgen, Selektionsmarker für E. coli
TRAM	„translocating chain associated membrane protein“, translokations-assoziiertes Membranprotein
Triton X-100	t-Oktylphenoxypolyethanol
Tris	Tris-(hydroxymethyl)-aminomethan
TRP1	Selektionsmarker für die Hefe
ts-	temperatur-sensitiv; ts-Mutanten zeigen erst oberhalb einer für die jeweilige Mutation charakteristischen Temperatur einen vom Wildtyp abweichenden Phänotyp
URA3	Selektionsmarker für die Hefe
wt	Wildtyp

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