Veränderungen im Proteom von Maus und Mensch durch Huntington’s ChoreaClaus Zabel234 Widmung13 Vorwort15250#2291161.11.2171.3181.3.1191.3.1.11.3.1.220211.3.1.31.3.222231.3.3241.4251.4.11.4.2261.4.327450#5791.4.41.5291.5.11.5.2301.5.331543#4711.5.4321.5.53323344354.14.2364.34.3.1374.3.24.3.2.1383940414.3.2.2424.3.2.3434.3.2.44.4444.4.14.4.1.14.4.1.245464.4.1.347449#62548494.4.2504.4.2.1514.4.2.252534.5544.5.1554.5.24.6564.74.8574.9584.104.115595.15.1.1605.1.1.15.1.1.1.161543#3295.1.1.1.2625.1.1.263543#330544#333645.1.1.35.1.1.3.15.1.1.3.25.1.265543#330543#33666585#3595.1.2.167543#3165.1.2.268543#3275.1.35.1.3.1695.1.3.25.1.45.1.4.170543#3287172532#274459#3595.1.4.2735.25.2.15.2.1.1745.2.1.275547#7815.2.2765.2.2.1775.2.2.2519#2565.2.2.378543#3305.2.2.4795.2.3805.2.3.181543#3255.2.3.2825.2.3.35.2.45.2.4.183543#2915.2.4.2845.2.4.3543#291855.2.4.4543#5145.2.5866876.16.1.1886.1.26.1.2.16.1.2.2896.1.36.1.3.1906.1.3.2916.1.4926.293946.395796Abkürzungsverzeichnis Literaturverzeichnis97 Anhang110111112504#714113 Lebenslauf114 Eigene Veröffentlichungen115 Eidesstattliche Erklärung116deInhaltsverzeichnisHilfe Anhang

Striatum

Parietallappen

männlich

weiblich

männlich

weiblich

pH[a]

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

#

112

105

222

123

86

89

141

89

Tab. 12: Identifizierung von Proteinspots, welche sich in ihrer Expression zwischen zwei HD Patienten in Abhängigkeit von Geschlecht und Gehirnregion unterscheiden.

weiblich vs. männlich

Gewebe

Striatum

Parietallappen

pH

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

#

21

21

26

25

Parietallappen vs. Striatum

Geschlecht

weiblich

männlich

pH

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

#

15

6

21

18

Parietallappen vs. Striatum

Geschlecht

weiblich vs. männlich

weiblich vs. männlich

pH

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

#

32

10

10

5

Oben: Anzahl der unterschiedlichen Spots zwischen einem weiblichen (56) oder einem männlichen (93) HD Patienten und alters- und geschlechtsangeglichenen Kontrollen (99 bzw. 104). Mitte: Vergleich der Spotunterschiede in Abhängigkeit von Geschlecht und Gehirnregionen zwischen HD und Kontrolle. Unten: Spots, welche sich bei allen möglichen Kombinationen unterscheiden. Zeichenerklärung: ^[a]pH, pH-Bereich im Gel; #, Anzahl der Spots.

Unterschiede zwischen HD und Kontrolle gleich

pH

3,5 - 6

6 – 9,5

#

6

0

HD vs.

B3703

B4226

B4356

B4381

Kontrolle

B3700

B3816

B3959

B4625

pH[a]

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

#

98

103

189

135

69

(38)

85

80

Tab. 13: Untersuchung der HD-spezifischen Spotunterschiede beim vorderen Globus Cinguli bei post-mortem Gehirnen von vier weiblichen HD Patienten.

B3703

B4226

B4356

B4381

pH

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

3,5 - 6

6 – 9,5

B3703

11

14

10

12

4

17

B4226

11

14

10

5

18

7

B4356

10

12

10

5

5

6

B4381

4

17

18

7

5

6

Oben: Vergleich von vier HD Gehirnen mit alters- und geschlechtsangeglichenen Kontrollen. Mitte: Vergleich der ausgewerteten HD Gehirne untereinander auf Gemeinsamkeiten bei den Spotunterschieden. Unten: Gleichzeitiges Vorkommen bei verschiedenen HD Gehirnen von zwischen HD und Kontrolle differentiell exprimierten Spots. Es wurden nur Spots berücksichtigt, welche in mindestens 3 HD Gehirnen gleiche Unterschiede in der Expression aufwiesen. Zeichenerklärung: ^[a]pH, pH-Bereich im Gel; #, Anzahl der Spots; +, Spotunterschied kommt bei diesem HD Gehirn auch vor; -, Spotunterschied kommt bei diesem HD Gehirn nicht vor.

pH

#

Gehirn

Gehirn

B3703

B4226

B4356

B4381

B3703

3,5 - 6

1

+

+

+

-

6 – 9,5

3

+

+

+

-

1

+

-

+

+

B4226

3,5 - 6

1

-

+

+

+

6 – 9,5

3

+

+

+

-

B4356

3,5 - 6

1

+

+

+

-

1

-

+

+

+

6 – 9,5

3

+

+

+

-

1

+

-

+

+

B4381

3,5 - 6

1

+

-

+

+

1

-

+

+

+

6 – 9,5

1

+

-

+

+

Abb. 23: Darstellung der drei Proteinfraktionen am Beispiel der Leber von C57Bl/6 Mäusen Repräsentative Gele der Zytoplasmatischen/Nukleoplasmatischen (Zytoplasma)-, Membran (Membran)- und Kernfraktion (Kern) sind im einzelnen dargestellt. Alle drei Fraktionen wurden durch Großgel 2D-Elektrophorese aufgetrennt. In der Membranfraktion befinden sich viele Spots, die in der zytoplasmatischen/nukleoplasmatischen Fraktion nicht auftreten und umgekehrt. Pelletspezifische Spots finden sich bevorzugt in der basischen Seite und zytoplasmatische/nukleoplasmatische Fraktion spezifische Spots bevorzugt im sauren pH Bereich. Die Gel der Kernfraktion zeigt sehr basische Proteine. Die Abbildung ist der Veröffentlichung von Joachim Klose zur fraktionierten Proteinextraktion bei Geweben entnommen (Abb. 2; [88]).