Structural plasticity and post-translational modifications of C/EBP beta direct distinct myeloid cell fates
dc.contributor.author | Stoilova, Bilyana | |
dc.date.accessioned | 2017-06-18T12:20:25Z | |
dc.date.available | 2017-06-18T12:20:25Z | |
dc.date.created | 2013-06-03 | |
dc.date.issued | 2013-05-23 | |
dc.identifier.uri | http://edoc.hu-berlin.de/18452/17394 | |
dc.description.abstract | Der CCAAT enhancer binding protein beta (C/EBPβ) Transkriptionsfaktor reguliert die Differenzierung, Proliferation und Funktion vieler Zelltypen, einschließlich verschiedener Zellen des Immunsystems. Eine detaillierte molekulare Analyse des Mechanismus, wie C/EBPβ alternative Zellschicksale steuert, wurde jedoch bisher noch nicht unternommen. Es wurde gezeigt, dass die ektopische Expression von C/EBPβ in determinierten B- Vorläuferzellen diese zu inflammatorischen Makrophagen reprogrammieren kann. Wir haben dieses Reprogrammierungsystem verwendet, um die Strukturelemente in C/EBPβ, die für die Regulation der (Trans)Differenzierung durch C/EBPβ wichtig sind, zu untersuchen. Um die maßgeblichen C/EBPβ Proteinmodule für die Reprogrammierung zu bestimmen, wurden entweder C/EBPβ Wildtyp Isoformen oder Mutanten in primären murinen B-Vorläuferzellen ektopisch exprimiert. Die Analysen ergaben, dass die translational regulierten langen Isoformen LAP* and LAP, jedoch nicht die kurze Isoform LIP lymphoide Zellen zu myeloischen Zellen reprogrammieren können. Des weiteren haben wir gezeigt, dass die konservierten Regionen 2, 3 und 4 der C/EBPβ Transaktivierungsdomäne essentiell und ausreichend für die Konvertierung von B Zellen zu myeloischen Zellen sind. Die reprogrammierten myeloischen Zellen setzten sich aus einer heterogenen Population verschiedener myeloischer Zelltypen zusammen. Detaillierte Analysen von CD11b+ reprogrammierten Zellen zeigten, dass diskrete konservierte Regionen von C/EBPβ verschiedene pro- und anti-inflammatorische Gene und divergente Entwicklungsprogramme aktivierten. Des Weiteren führten nicht nur strukturelle C/EBPβ Mutanten sondern auch Puktmutationen an Stellen, die posttranslationalen Modifikationen (PTM) unterliegen, zu verschiedenen Reprogrammierungsergebnissen. Diese Daten zeigen, dass die C/EBPβ abhängige myeloische Diversifikation durch die Integration von strukturellen C/EBPβ Proteinmodulen und deren signalabhängigen PTMs erreicht wird. | ger |
dc.description.abstract | The CCAAT enhancer binding protein beta (C/EBPβ) transcription factor regulates differentiation, proliferation, and functionality of many cell types, including various cells of the immune system. A detailed molecular understanding of how C/EBPβ directs alternative cell fates remains largely elusive. Ectopic expression of C/EBPβ has been previously shown to reprogram committed B cell progenitors into inflammatory macrophages. We took advantage of this reprogramming system in order to examine how C/EBPβ regulates (trans)differentiation. To determine which C/EBPβ protein modules are important for reprogramming, C/EBPβ wild type isoforms and mutants were ectopically expressed in primary mouse B cell progenitors. The data showed that the translationally regulated long isoforms LAP* and LAP, but not the N-terminally truncated isoform LIP can reprogram lymphoid cells into myeloid cells. Furthermore, we found that conserved regions 2,3 and 4 in the C/EBPβ protein transactivation domain are necessary and sufficient for B-to-myeloid cell conversion. Interestingly, the reprogrammed myeloid cells were found to represent a heterogeneous mixture of different myeloid cell types. Detailed analyses of the reprogrammed CD11b+ cells revealed that discrete conserved regions in C/EBPβ activated distinct pro- and anti-inflammatory genes and triggered divergent differentiation programs. Moreover, not only structural C/EBPβ mutants, but also post-translational modification (PTM) site mutations led to different reprogramming outcomes. These data suggest that C/EBPβ orchestrates myeloid diversification by integrating PTMs with structural plasticity as signal dependent adaptable modular properties to determine cell fate. | eng |
dc.language.iso | eng | |
dc.publisher | Humboldt-Universität zu Berlin, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät I | |
dc.rights | Namensnennung - Keine kommerzielle Nutzung - Keine Bearbeitung | |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/de/ | |
dc.subject | Transdifferenzierung | ger |
dc.subject | Hämatopoese | ger |
dc.subject | C/EBPβ | ger |
dc.subject | myeloische Zellen | ger |
dc.subject | Reprogrammierung | ger |
dc.subject | hematopoiesis | eng |
dc.subject | C/EBPβ | eng |
dc.subject | myeloid lineage | eng |
dc.subject | reprogramming | eng |
dc.subject | trans-differentiation | eng |
dc.subject.ddc | 570 Biologie | |
dc.title | Structural plasticity and post-translational modifications of C/EBP beta direct distinct myeloid cell fates | |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.identifier.urn | urn:nbn:de:kobv:11-100210255 | |
dc.identifier.doi | http://dx.doi.org/10.18452/16742 | |
dc.identifier.alephid | BV041061490 | |
dc.date.accepted | 2013-02-19 | |
dc.contributor.referee | Leutz, Achim | |
dc.contributor.referee | Rajewsky, Klaus | |
dc.contributor.referee | Sommer, Thomas | |
dc.subject.dnb | 32 Biologie | |
dc.subject.rvk | WE 2600 | |
local.edoc.pages | 127 | |
local.edoc.type-name | Dissertation | |
bua.department | Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät I |