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2019-09-27Dissertation DOI: 10.18452/20479
Identification and Characterization of miRNA regulatory networks
dc.contributor.authorFilipchyk, Andrei
dc.date.accessioned2019-09-27T08:36:46Z
dc.date.available2019-09-27T08:36:46Z
dc.date.issued2019-09-27none
dc.identifier.urihttp://edoc.hu-berlin.de/18452/21305
dc.description.abstractPost-transkriptionelle Genregulation ist ein zentraler Mechanismus, den lebende Organismen nutzen, um Funktionalität, Entwicklung und Anpassung zu gewährleisten. Defizite in diesem Mechanismus haben zahlreiche Krankheiten und Fehlfunktionen zur Folge. Post-transkriptionelle Genregulation wird von RNA-bindenden Proteinen (RBPs) ausgeführt. Ihr kombinatorisches Agieren ermöglicht eine genau abgestimmte Kontrolle räumlicher und zeitlicher Genexpression. Ein RBP erkennt seine Zielmoleküle typischerweise anhand sogenannter Bindemotive: Nukleotidsequenzen, die kompatibel sind mit einer Aminosäuretasche innerhalb des Proteins. Es gibt jedoch einen Sonderfall der Zielmolekülerkennung, der überRNAs, insbesondere microRNAs (miRNAs), vermittelt wird. miRNAs sind im Genom kodierte 20-25 Nukleotid lange RNAs, die in Argonaut (Ago)-Proteine geladen werden können, um diese zu ihren Zielmolekülen (z.B mRNAs) zu navigieren. Es wird angenommen, dass miRNA:Ago-Komplexe nahezu alle zellulären Prozesse kontrollieren. Dementsprechend werden miRNA-Fehlfunktionen (z.B. verursacht durch Mutation nur eines einzelnen Nukleotids in einer Bindestelle) mit zahlreichen Erkrankungen in Verbindung gebracht. Die Charakterisierung aller miRNA-Zielmoleküle („miRNA targetome“) ist eine der wichtigsten Fragen, die mithilfe der Systembiologie adressiert werden kann.ger
dc.description.abstractPost-transcriptional gene regulation is a key mechanism exploited by living organisms to ensure their functionality, development and adaptation. Deficiencies in this mechanism lead to various diseases and malfunctions. Post-transcriptional gene regulation is exerted by RNA-binding proteins (RBPs). Their combinatorial action allows fine-tuned control over spatial and temporal gene expression to meet the actual cell demands. An RBP typically recognizes its targets via so called binding motifs: nucleotide sequences compatible with an amino-acid pocket inside the protein. However, there is a special case of target recognition guided by RNAs. In particular, micro RNAs(miRNAs) – 20-25 nucleotide long transcripts encoded in the genome–can be loaded into Argonaute (Ago) proteins to navigate them to their target RNAs. It is estimated that miRNA:Ago complexes control virtually all processes occurring in the cell. Consequently, malfunctions in the miRNA pathway (including even a single nucleotide mutation in a binding site) are implicated in multiple disorders. Therefore, the characterization of the “miRNA targetome” is one of the most important questions addressed to the systems biologyeng
dc.language.isoengnone
dc.publisherHumboldt-Universität zu Berlin
dc.rights(CC BY-NC 3.0 DE) Namensnennung - Nicht kommerziell 3.0 Deutschlandger
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/de/
dc.subjectmiRNAger
dc.subjectPost-transkriptionelle Genregulationger
dc.subjectBioinformatikger
dc.subjectC. elegansger
dc.subjectmiRNAeng
dc.subjectPost-transcriptional gene regulationeng
dc.subjectBioinformaticseng
dc.subjectC. eleganseng
dc.subject.ddc570 Biologienone
dc.titleIdentification and Characterization of miRNA regulatory networksnone
dc.typedoctoralThesis
dc.identifier.urnurn:nbn:de:kobv:11-110-18452/21305-1
dc.identifier.doihttp://dx.doi.org/10.18452/20479
dc.date.accepted2018-04-24
dc.contributor.refereeRajewsky, Nikolaus
dc.contributor.refereeHerrmann, Andreas
dc.contributor.refereeLandthaler, Markus
dc.subject.rvkWD 5355
dc.subject.rvkWG 1900
dc.subject.rvkWD 9200
local.edoc.pages111none
local.edoc.type-nameDissertation
bua.departmentLebenswissenschaftliche Fakultätnone

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