Identification and Characterization of miRNA regulatory networks
dc.contributor.author | Filipchyk, Andrei | |
dc.date.accessioned | 2019-09-27T08:36:46Z | |
dc.date.available | 2019-09-27T08:36:46Z | |
dc.date.issued | 2019-09-27 | none |
dc.identifier.uri | http://edoc.hu-berlin.de/18452/21305 | |
dc.description.abstract | Post-transkriptionelle Genregulation ist ein zentraler Mechanismus, den lebende Organismen nutzen, um Funktionalität, Entwicklung und Anpassung zu gewährleisten. Defizite in diesem Mechanismus haben zahlreiche Krankheiten und Fehlfunktionen zur Folge. Post-transkriptionelle Genregulation wird von RNA-bindenden Proteinen (RBPs) ausgeführt. Ihr kombinatorisches Agieren ermöglicht eine genau abgestimmte Kontrolle räumlicher und zeitlicher Genexpression. Ein RBP erkennt seine Zielmoleküle typischerweise anhand sogenannter Bindemotive: Nukleotidsequenzen, die kompatibel sind mit einer Aminosäuretasche innerhalb des Proteins. Es gibt jedoch einen Sonderfall der Zielmolekülerkennung, der überRNAs, insbesondere microRNAs (miRNAs), vermittelt wird. miRNAs sind im Genom kodierte 20-25 Nukleotid lange RNAs, die in Argonaut (Ago)-Proteine geladen werden können, um diese zu ihren Zielmolekülen (z.B mRNAs) zu navigieren. Es wird angenommen, dass miRNA:Ago-Komplexe nahezu alle zellulären Prozesse kontrollieren. Dementsprechend werden miRNA-Fehlfunktionen (z.B. verursacht durch Mutation nur eines einzelnen Nukleotids in einer Bindestelle) mit zahlreichen Erkrankungen in Verbindung gebracht. Die Charakterisierung aller miRNA-Zielmoleküle („miRNA targetome“) ist eine der wichtigsten Fragen, die mithilfe der Systembiologie adressiert werden kann. | ger |
dc.description.abstract | Post-transcriptional gene regulation is a key mechanism exploited by living organisms to ensure their functionality, development and adaptation. Deficiencies in this mechanism lead to various diseases and malfunctions. Post-transcriptional gene regulation is exerted by RNA-binding proteins (RBPs). Their combinatorial action allows fine-tuned control over spatial and temporal gene expression to meet the actual cell demands. An RBP typically recognizes its targets via so called binding motifs: nucleotide sequences compatible with an amino-acid pocket inside the protein. However, there is a special case of target recognition guided by RNAs. In particular, micro RNAs(miRNAs) – 20-25 nucleotide long transcripts encoded in the genome–can be loaded into Argonaute (Ago) proteins to navigate them to their target RNAs. It is estimated that miRNA:Ago complexes control virtually all processes occurring in the cell. Consequently, malfunctions in the miRNA pathway (including even a single nucleotide mutation in a binding site) are implicated in multiple disorders. Therefore, the characterization of the “miRNA targetome” is one of the most important questions addressed to the systems biology | eng |
dc.language.iso | eng | none |
dc.publisher | Humboldt-Universität zu Berlin | |
dc.rights | (CC BY-NC 3.0 DE) Namensnennung - Nicht kommerziell 3.0 Deutschland | ger |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/de/ | |
dc.subject | miRNA | ger |
dc.subject | Post-transkriptionelle Genregulation | ger |
dc.subject | Bioinformatik | ger |
dc.subject | C. elegans | ger |
dc.subject | miRNA | eng |
dc.subject | Post-transcriptional gene regulation | eng |
dc.subject | Bioinformatics | eng |
dc.subject | C. elegans | eng |
dc.subject.ddc | 570 Biologie | none |
dc.title | Identification and Characterization of miRNA regulatory networks | none |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.identifier.urn | urn:nbn:de:kobv:11-110-18452/21305-1 | |
dc.identifier.doi | http://dx.doi.org/10.18452/20479 | |
dc.date.accepted | 2018-04-24 | |
dc.contributor.referee | Rajewsky, Nikolaus | |
dc.contributor.referee | Herrmann, Andreas | |
dc.contributor.referee | Landthaler, Markus | |
dc.subject.rvk | WD 5355 | |
dc.subject.rvk | WG 1900 | |
dc.subject.rvk | WD 9200 | |
local.edoc.pages | 111 | none |
local.edoc.type-name | Dissertation | |
bua.department | Lebenswissenschaftliche Fakultät | none |