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2021-01-05Dissertation DOI: 10.18452/22252
Polymorphism of Biomembranes at the Nanoscale
dc.contributor.authorSatarifard, Vahid
dc.date.accessioned2021-01-05T11:46:04Z
dc.date.available2021-01-05T11:46:04Z
dc.date.issued2021-01-05none
dc.identifier.urihttp://edoc.hu-berlin.de/18452/22936
dc.description.abstractIn dieser Arbeit untersuchen wir den Polymorphismus von Biomembranen im Nanometerbereich anhand von Computermodellen. In Kapitel drei werden auf Dissipative Particle Dynamis basierende molekulare Simulationen genutzt, um die Wechselwirkungen zwischen Membranen und Nanotropfen mit hohen Oberflächenspannungen in der Größenordnung von Milli Newton pro Meter zu untersuchen. Wir zeigen, dass Nanotropfen eine negative Linienspannung an der dreiphasigen Kontaktlinie mit der Membran aufweisen. Die negative Linienspannung führt zu einem spontanen Symmetriebruch des Membran-Tropfensystems und zur Bildung eines enggeschlossenen länglichen Membranhalses. In Kapitel vier untersuchen wir Nanotropfen mit niedrigen Grenzflächenspannungen in der Größenordnung von Mikro-Newton pro Meter. Eine Energieminimierung ermöglicht uns, eine Vielzahl von Parametern zu variieren und die Abhängigkeit der Membranbenet-zungsphänomene von der Grenzflächenspannung, der Biegesteifigkeit, der Linienspannung und der spontanen Krümmung systematisch zu bestimmen. Wir beobachten eine neue morphologische Transformation, die sowohl die Vesikel als auch das Tröpfchen betrifft und eine weiter Geometrie mit gebrochener Rotationssymmetrie. Schließlich bestimmen wir die Grenze zwischen symmetrischen und asymmetrischen Kontaktlinien innerhalb des dreidimensionalen Parameterraums bei verschwindender spontanen Krümmung. In Kapitel fünf verwenden wir molekulare Simulationen, um die morphologischen Transformationen einzelner Nanovesikel mit unterschiedlichem Grad an Asymmetrie zwischen den beiden Schichten der Doppelmembranen zu beobachten. Wir beginnen mit kugelförmigen Vesikeln, die ein bestimmtes Wasservolumen einschließen und aus einer bestimmten Gesamtzahl von Lipiden bestehen. Wenn ihr Volumen verringert wird, verwandeln sich die kugelförmigen Vesikel in eine Vielzahl von nicht kugelförmigen Formen. Dieser Polymorphismus kann durch Umverteilung weniger Lipide zwischen der inneren und äußeren Schicht der Membranen kontrolliert werden.ger
dc.description.abstractIn this thesis, we use computational methods to study polymorphism of biomembranes at the nanoscales. In chapter three, we use molecular simulations based on dissipative particle dynamics to investigate the interaction of membranes with nanodroplets at high interfacial tensions of the order of milli Newton per meter. We find that nanodroplets have negative line tension at the three phase contact line on the membrane. The negative line tension leads to spontaneous symmetry breaking of the membrane-droplet system and formation of a tight-lipped membrane neck. In chapter four, we study nanodroplets with low interfacial tensions of the order of micro Newton per meter. We use energy minimization, which allows us to explore a wide range of parameters and to systemati-cally determine the dependence of membrane wetting phenomena on interfacial tension, bending rigidity, line tension, and spontaneous curvature. We observe a new morphological transformation that involves both vesicles and droplets, leads to another regime with broken rotational symmetry. Finally, we determine the boundary between symmetric and asymmetric contact line geometries within the three-dimensional parameter space in vanishing spontaneous curvature. In chapter five, we use molecular simulations to monitor the morphological transformations of individual nanovesicles with different degrees of asymmetry between the two leaflets of the bilayer membranes. We start with the assembly of spherical vesicles that enclose a certain volume of water and contain a certain total number of lipids. When we reduce their volume, the spherical vesicles transform into a multitude of nonspherical shapes such as oblates and stomatocytes as well as prolates and dumbbells. This polymorphism can be controlled by redistributing a small fraction of lipids between the inner and outer leaflets of the bilayer membranes. As a consequence, the inner and the outer leaflets experience different mechanical tensions.eng
dc.language.isoengnone
dc.publisherHumboldt-Universität zu Berlin
dc.rights(CC BY 4.0) Attribution 4.0 Internationalger
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectBiomembranger
dc.subjectVesikelger
dc.subjectNanodropletger
dc.subjectPinocytoseger
dc.subjectKontaktlinieger
dc.subjectSchnurger
dc.subjectMembranhalsger
dc.subjectBiomembraneeng
dc.subjectVesicleeng
dc.subjectNanodropleteng
dc.subjectPinocytosiseng
dc.subjectContact lineeng
dc.subjectLine tensioneng
dc.subjectMembrane neckeng
dc.subject.ddc530 Physiknone
dc.titlePolymorphism of Biomembranes at the Nanoscalenone
dc.typedoctoralThesis
dc.identifier.urnurn:nbn:de:kobv:11-110-18452/22936-8
dc.identifier.doihttp://dx.doi.org/10.18452/22252
dc.date.accepted2020-06-23
dc.contributor.refereeLipowsky, Reinhard
dc.contributor.refereeKlapp, Sabine
dc.contributor.refereeGompper, Gerhard
local.edoc.pages169none
local.edoc.type-nameDissertation
local.edoc.institutionMathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultätnone

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